RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 SLC34A1Q06495 639 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 GRAPQ13588 217 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PTPRNQ16849 979 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 AFG1LQ8WV93 481 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 MDM4O15151 490 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CLIC2O15247 247 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 KCNQ3O43525 872 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 HPGDP15428 266 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 IRAK1P51617 712 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SLC7A5Q01650 507 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CDO1Q16878 200 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 HELQQ8TDG4 1101 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1W2PRG6 482 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC182A6NF36 153 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 KITP10721 976 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 GPD1P21695 349 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 YWHAQP27348 245 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SLC11A2P49281 568 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 HUNKP57058 714 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF846Q147U1 533 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SMIM5Q71RC9 77 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 DNAJC7Q99615 494 aa6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 MGAT4DA6NG13 374 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PSMD11O00231 422 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CAND2O75155 1236 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SLC25A27O95847 323 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ALADP13716 330 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CES1P23141 567 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 GRK4P32298 578 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SLC26A2P50443 739 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 MAPK7Q13164 816 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 NUP93Q8N1F7 819 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 BTG4Q9NY30 223 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 DMTF1Q9Y222 760 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 KIF28PB7ZC32 967 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 FAM187BQ17R55 369 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF605Q86T29 641 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 RDH11Q8TC12 318 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 THAP1Q9NVV9 213 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 NEDD4P46934 1319 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 MPZL2O60487 215 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SERPINE1P05121 402 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 FMO5P49326 533 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SULT1E1P49888 294 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PTPAQ15257 358 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PIDD1Q9HB75 910 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 HHATLQ9HCP6 504 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ZMYND10O75800 440 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 LYNP07948 512 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CYP2A7P20853 494 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SERPINB5P36952 375 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 BROXQ5VW32 411 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 THRSPQ92748 146 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PANX3Q96QZ0 392 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 C3orf18Q9UK00 162 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CAPN15O75808 1086 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 APRTP07741 180 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms