RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616386.1

PVT1-224, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 113 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-224	ENST00000616386		F8VP50	259 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386		K7ENM7	598 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	CLDN5	O00501	218 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	MAST4	O15021	2626 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	MDM4	O15151	490 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	CYP26A1	O43174	497 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	HUS1	O60921	280 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	CS	O75390	466 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TOM1L1	O75674	476 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TNFSF15	O95150	251 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	KIF20A	O95235	890 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	SEMA4F	O95754	770 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	MT-CO3	P00414	261 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	ITGB3	P05106	788 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	CLTA	P09496	248 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TYR	P14679	529 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	IFNAR1	P17181	557 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	PLCG1	P19174	1290 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TYMP	P19971	482 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	CR2	P20023	1033 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	PRKCH	P24723	683 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	DGKG	P49619	791 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TAF6	P49848	677 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	SMTN	P53814	917 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	UCN	P55089	124 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	CDH8	P55286	799 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	NID2	Q14112	1375 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TRIM29	Q14134	588 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	KRT32	Q14532	448 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	PDIA5	Q14554	519 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	NCAPH	Q15003	741 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TGIF1	Q15583	401 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	NTRK3	Q16288	839 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	ECM1	Q16610	540 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	PTPRN	Q16849	979 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	ZNF787	Q6DD87	383 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	VASH2	Q86V25	355 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	OSTM1	Q86WC4	334 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	MYCT1	Q8N699	235 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	NECAB1	Q8N987	351 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TERB1	Q8NA31	727 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TTC9	Q92623	222 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	KIFAP3	Q92845	792 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	KLK6	Q92876	244 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	IGSF8	Q969P0	613 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	FBXO32	Q969P5	355 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	MYLPF	Q96A32	169 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	BIRC7	Q96CA5	298 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	RNF31	Q96EP0	1072 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	MTA3	Q9BTC8	594 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	LHX5	Q9H2C1	402 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	MTG2	Q9H4K7	406 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TMEM206	Q9H813	350 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	GCNT4	Q9P109	453 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	DSE	Q9UL01	958 aa		2.55	□□□□□ -2
PVT1-224	ENST00000616386	HCN2	Q9UL51	889 aa		2.55	□□□□□ -2

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