RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614239.1

LHX1-201, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX1, Length 3,425 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-201ENST00000614239 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 AP3B1O00203 1094 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 SHMT1P34896 483 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 CRKP46108 304 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 LRP8Q14114 963 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 TTC13Q8NBP0 860 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 FAM84AQ96KN4 292 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PARVBQ9HBI1 364 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 MYPNQ86TC9 1320 aa14.63□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 A0A1W2PPW3 197 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 DNAJA2O60884 412 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 CHEK2O96017 543 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 CAV1Q03135 178 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 ZBBXA8MT70 800 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 FAM86B1E9PN63 330 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 CYB561D2O14569 222 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 BMP3P12645 472 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PKNOX1P55347 436 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 TPTEP56180 551 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 SLC35C1Q96A29 364 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 WDR70Q9NW82 654 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 CHD4Q14839 1912 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 E2F8A0AVK6 867 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 TISP43B9A030 160 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 BBOX1O75936 387 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 BST1Q10588 318 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 NME3Q13232 169 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.62□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 CFAP99D6REC4 459 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 EDIL3O43854 480 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 CHRNA5P30532 468 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 FLOT2Q14254 428 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PGS1Q32NB8 556 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PPM1NQ8N819 430 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 BBOF1Q8ND07 529 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 BORCS5Q969J3 196 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 AGAP3Q96P47 875 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 GBA3Q9H227 469 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 DSEQ9UL01 958 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 POMPQ9Y244 141 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 TMEM150BA6NC51 233 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 RAD17O75943 681 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 ESRRBO95718 433 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PHKA2P46019 1235 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PTK7Q13308 1070 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 CCNIQ14094 377 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 KRT72Q14CN4 511 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 ODR4Q5SWX8 454 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.61□□□□□ -0.07
LHX1-201ENST00000614239 ZNF398Q8TD17 642 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms