RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 SDC4P31431 198 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 GBP1P32455 592 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 NOS2P35228 1153 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 IRS1P35568 1242 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 SLC1A1P43005 524 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 TUBP50607 506 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 DAOAP59103 153 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 TWF1Q12792 350 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 DDR2Q16832 855 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 CYP4A22Q5TCH4 519 aa9.77□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 EFHBQ8N7U6 833 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 FBXO32Q969P5 355 aa9.77□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 TMEM191CA6NGB0 347 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 TULP2O00295 520 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 DAB1O75553 588 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 LTFP02788 710 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 USP17L7P0C7H9 530 aa9.76□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 GPD1P21695 349 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 MAN1A1P33908 653 aa9.76□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 PTPN9P43378 593 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 NRIP1P48552 1158 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 CACNA2D1P54289 1103 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 AIF1P55008 147 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 MMRN1Q13201 1228 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 RNF139Q8WU17 664 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 CNPY3Q9BT09 278 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 LZTFL1Q9NQ48 299 aa9.76□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 TMEM59LQ9UK28 342 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.76□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.76□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 DPYSL4O14531 572 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 SLC2A3P11169 496 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 PDGFRAP16234 1089 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 EPHA5P54756 1037 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 ITIH3Q06033 890 aa9.75□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 NNTQ13423 1086 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 KCNC3Q14003 757 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 HADHQ16836 314 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 CCDC142Q17RM4 750 aa9.75□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.75□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 EPOPA6NHQ4 379 aa9.74□□□□□ -0.85
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