RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	KAT5	Q92993	513 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYLD	Q9NQC7	956 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PQH9	124 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	TULP2	O00295	520 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	TLR5	O60602	858 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXCL12	P48061	93 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB41	Q5JT25	222 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC39C	Q8N584	583 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	E2F8	A0AVK6	867 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFATC1	O95644	943 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHCR24	Q15392	516 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIGZ	Q86VD9	579 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD101	Q93033	1021 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPC1	Q9H2F5	836 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014		O00370	1275 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	MDM4	O15151	490 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	P4HA2	O15460	535 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF40	O75150	1001 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	GABBR2	O75899	941 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	CALCA	P01258	141 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	DRD1	P21728	446 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF132	P52740	706 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF276	Q8N554	614 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFAP2B	Q92481	460 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	P2RY11	Q96G91	374 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	EML5	Q05BV3	1969 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014		K7EQS6	105 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	HR	O43593	1189 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNA14	O95837	355 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	RARG	P13631	454 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOXA6	P31267	233 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC6A11	P48066	632 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	FNTB	P49356	437 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	AMPD2	Q01433	879 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDE4C	Q08493	712 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR1H3	Q13133	447 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	HTR3D	Q70Z44	454 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	NT5C1B	Q96P26	610 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRF1	P10914	325 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	VDR	P11473	427 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27

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