RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCNM1Q9BWG6 230 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XYLT2Q9H1B5 865 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMYD3Q9H7B4 428 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZZEF1O43149 2961 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM8BA6NDV4 472 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TULP3O75386 442 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXD12P35452 270 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUBP50607 506 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX30Q5VWJ9 437 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTBD8Q5XKL5 378 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BBS7Q8IWZ6 715 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NELFCDQ8IXH7 590 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAT16Q8N8M0 369 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TERB1Q8NA31 727 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCAMP5Q8TAC9 235 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNV2Q8TDN2 545 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCFD1Q8WVM8 642 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF516Q92618 1163 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GATA6Q92908 595 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHX58Q96C10 678 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNK16Q96T55 309 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC32A1Q9H598 525 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCSER2Q9H7U1 834 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PILRBQ9UKJ0 227 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PI4KAP42356 2102 aa13.97□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDH15Q96QU1 1955 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D3BA6NDS4 549 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP5Z1O43299 807 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITPKAP23677 461 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EHHADHQ08426 723 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF699Q32M78 642 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C10orf76Q5T2E6 689 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1211LQ6NV74 962 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNC13DQ70J99 1090 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMARCD1Q96GM5 515 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C7orf25Q9BPX7 421 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED10Q9BTT4 135 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPHK2Q9NRA0 654 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL37Q9NZH6 218 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GMIPQ9P107 970 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEC1Q9P2X7 70 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa13.96□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKAP13Q12802 2813 aa13.96□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM92AA1XBS5 289 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPTLC2O15270 562 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHACTR2O75167 634 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP6R2O75170 966 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLSTN1O94985 981 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFIP05156 583 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRF1P10914 325 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXB2P14652 356 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABRG2P18507 467 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASP4P49662 377 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH8P55286 799 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BIRC3Q13489 604 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMT2Q1RMZ1 405 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANO4Q32M45 955 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT18Q6ZVK8 323 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAQR9Q6ZVX9 377 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf56Q8IXR9 622 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQUBQ8NA54 791 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WBP2Q969T9 261 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNIP3Q96KP6 325 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NACA2Q9H009 215 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEF1Q9HAY2 307 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT82Q9NSB4 513 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COMMD8Q9NX08 183 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STX6O43752 255 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP1G2O75843 785 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NTSR1P30989 418 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEMA3BQ13214 749 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUOXA1Q1HG43 343 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF667Q5HYK9 610 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC36A4Q6YBV0 504 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIP4P1Q86T03 277 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM25Q86YD3 366 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FUKQ8N0W3 1084 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP76Q8TAP6 659 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHO2Q8TD55 490 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSCN3Q9NQT6 498 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCN2Q9UL51 889 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A14Q9UN76 642 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STARD13Q9Y3M8 1113 aa13.94□□□□□ -0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms