RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa7.14□□□□□ -1.27
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CCL20-202ENST00000409189 JADE2Q9NQC1 790 aa7.14□□□□□ -1.27
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CCL20-202ENST00000409189 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.13□□□□□ -1.27
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CCL20-202ENST00000409189 ETFBP38117 255 aa7.12□□□□□ -1.27
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CCL20-202ENST00000409189 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.12□□□□□ -1.27
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CCL20-202ENST00000409189 CENPPQ6IPU0 288 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.272e-9■□□□□ 8.7
CCL20-202ENST00000409189 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CNGA4Q8IV77 575 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 LRRC8AQ8IWT6 810 aa7.12□□□□□ -1.27
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