RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
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GNPTAB-202ENST00000392919 TDP1Q9NUW8 608 aa28.68■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 ZMYM5Q9UJ78 669 aa28.68■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 FHOD1Q9Y613 1164 aa28.68■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 O00370 1275 aa28.67■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 GAS6Q14393 721 aa28.67■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 SYCP1Q15431 976 aa28.67■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM68Q6AZZ1 485 aa28.67■■■□□ 2.18
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GNPTAB-202ENST00000392919 NUP93Q8N1F7 819 aa28.67■■■□□ 2.18
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GNPTAB-202ENST00000392919 GANQ9H2C0 597 aa28.67■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 TRPC7Q9HCX4 862 aa28.67■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
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GNPTAB-202ENST00000392919 SCAMP5Q8TAC9 235 aa28.66■■■□□ 2.18
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GNPTAB-202ENST00000392919 HPS4Q9NQG7 708 aa28.66■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 IL37Q9NZH6 218 aa28.66■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa28.66■■■□□ 2.18
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GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF445P59923 1031 aa28.65■■■□□ 2.18
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GNPTAB-202ENST00000392919 PON2Q15165 354 aa28.65■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 CNGA2Q16280 664 aa28.65■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 SMYD5Q6GMV2 418 aa28.65■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 LCLAT1Q6UWP7 414 aa28.65■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 NELL1Q92832 810 aa28.65■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 MSANTD3Q96H12 275 aa28.65■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 C2orf78A6NCI8 922 aa28.64■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 SOBPA7XYQ1 873 aa28.64■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa28.64■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 EPHB6O15197 1021 aa28.64■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa28.64■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa28.64■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 SUMF1Q8NBK3 374 aa28.64■■■□□ 2.18
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBTB44Q8NCP5 570 aa28.64■■■□□ 2.18
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GNPTAB-202ENST00000392919 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa28.64■■■□□ 2.18
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GNPTAB-202ENST00000392919 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
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GNPTAB-202ENST00000392919 Q6ZS52 159 aa28.63■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 UBA3Q8TBC4 463 aa28.63■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 CHFRQ96EP1 664 aa28.63■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF9Q9HAQ2 790 aa28.63■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 COMMD8Q9NX08 183 aa28.63■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP28.63■■■□□ 2.17
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GNPTAB-202ENST00000392919 SATB1Q01826 763 aa28.62■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 PDE4CQ08493 712 aa28.62■■■□□ 2.17
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GNPTAB-202ENST00000392919 C1orf228Q6PIY5 440 aa28.62■■■□□ 2.17
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GNPTAB-202ENST00000392919 FAM71AQ8IYT1 594 aa28.62■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
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GNPTAB-202ENST00000392919 STK33Q9BYT3 514 aa28.62■■■□□ 2.17
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GNPTAB-202ENST00000392919 HESX1Q9UBX0 185 aa28.62■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa28.62■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM92AA1XBS5 289 aa28.61■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 TULP2O00295 520 aa28.61■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP26A1O43174 497 aa28.61■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 SERPINC1P01008 464 aa28.61■■■□□ 2.17
GNPTAB-202ENST00000392919 CKMP06732 381 aa28.61■■■□□ 2.17
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