RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TYMPP19971 482 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GCSHP23434 173 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM187BQ17R55 369 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DPY19L1Q2PZI1 675 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM63BQ5T3F8 832 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IRGCQ6NXR0 463 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIRREL2Q6UWL6 708 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MFSD7Q6UXD7 560 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NAPRTQ6XQN6 538 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SFTPA2Q8IWL1 248 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NLGN4XQ8N0W4 816 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNF169Q8NCN4 708 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TBC1D16Q8TBP0 767 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DIO2Q92813 273 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UIMC1Q96RL1 719 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ALG2Q9H553 416 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UBTD1Q9HAC8 227 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM45AQ9NWC5 275 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NDOR1Q9UHB4 597 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TUBE1Q9UJT0 475 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DSEQ9UL01 958 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RIMKLBQ9ULI2 386 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TELO2Q9Y4R8 837 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SEC16AO15027 2179 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PDZD2O15018 2839 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LILRA5A6NI73 299 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 A8MZ25 164 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L15C9J2P7 530 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L13C9JLJ4 530 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L12C9JPN9 530 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L11C9JVI0 530 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L21D6R901 530 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L18D6R9N7 530 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L22D6RA61 530 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L17D6RBQ6 530 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L19D6RCP7 530 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L20D6RJB6 530 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PJA2O43164 708 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPRY3O43610 288 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZEB2O60315 1214 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRAMEF10O60809 474 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP12O75317 370 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 INHBAP08476 426 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCNA5P22460 613 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CASRP41180 1078 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLCN3P51790 818 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GNB1P62873 340 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DUSP2Q05923 314 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADCY2Q08462 1091 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L24Q0WX57 530 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPP2R5DQ14738 602 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYBPC3Q14896 1274 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAPKAPK3Q16644 382 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMTC4Q5T4D3 741 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LCN10Q6JVE6 187 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MTHFD1LQ6UB35 978 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LCTLQ6UWM7 567 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GFRALQ6UXV0 394 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TUBA1AQ71U36 451 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OTOP3Q7RTS5 596 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PNPLA1Q8N8W4 532 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR10V1Q8NGI7 309 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM171Q8WVE6 324 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BTN2A2Q8WVV5 523 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARNTL2Q8WYA1 636 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMARCD2Q92925 531 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PNKPQ96T60 521 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PIP5K1AQ99755 562 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AMNQ9BXJ7 453 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PANK3Q9H999 370 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ING3Q9NXR8 418 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WHRNQ9P202 907 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RASAL2Q9UJF2 1139 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC88CQ9P219 2028 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNCP24821 2201 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DNAJA2O60884 412 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXO24O75426 580 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FSBPO95073 299 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLAUP00749 431 aa-1.46□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms