RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 PCSK2P16519 638 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 CYP2F1P24903 491 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 AVPR1AP37288 418 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 FNTBP49356 437 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 RAB15P59190 212 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 RBP5P82980 135 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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CTXN3-201ENST00000379445 SQSTM1Q13501 440 aa7.45□□□□□ -1.22
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CTXN3-201ENST00000379445 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 TAF12Q16514 161 aa7.45□□□□□ -1.22
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CTXN3-201ENST00000379445 TMEM196Q5HYL7 178 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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CTXN3-201ENST00000379445 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.45□□□□□ -1.22
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CTXN3-201ENST00000379445 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 FAM171BQ6P995 826 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 MON1AQ86VX9 555 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 LONP2Q86WA8 852 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 TDP1Q9NUW8 608 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 INTS13Q9NVM9 706 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 SPTLC2O15270 562 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 TGFB1I1O43294 461 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 RETP07949 1114 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 KRT19P08727 400 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 ARSAP15289 507 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 PCSK1P29120 753 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 CNR2P34972 360 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 MAGEA11P43364 429 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 LHX1P48742 406 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 EPHB1P54762 984 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 STK38Q15208 465 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF77Q15935 545 aa7.44□□□□□ -1.22
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CTXN3-201ENST00000379445 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 SLC22A12Q96S37 553 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 RBSNQ9H1K0 784 aa7.44□□□□□ -1.22
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CTXN3-201ENST00000379445 EBF3Q9H4W6 596 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 RAB23Q9ULC3 237 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 USP18Q9UMW8 372 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF233A6NK53 670 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 LRP3O75074 770 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 ATP2C2O75185 946 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 YEATS4O95619 227 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 PDGFAP04085 211 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 SDHBP21912 280 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 LMO2P25791 158 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 ARHGAP8P85298 464 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 SPEM2Q0P670 501 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 MTF1Q14872 753 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 AGERQ15109 404 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 SURF1Q15526 300 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 TCEA2Q15560 299 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 TBCELQ5QJ74 424 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 C14orf80Q86SX3 495 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 WDR49Q8IV35 697 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTXN3-201ENST00000379445 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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