RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300648.6

GCN1-201, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GCN1, Length 8,675 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-201ENST00000300648 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 TPBGLP0DKB5 382 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 TRAF3Q13114 568 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 SBK1Q52WX2 424 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 CENPTQ96BT3 561 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 BTBD10Q9BSF8 475 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 BTBD3Q9Y2F9 522 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 MYH8P13535 1937 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 PRKCBP05771 671 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 AMER2Q8N7J2 671 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 HDHD2Q9H0R4 259 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 NEK6Q9HC98 313 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 AHCYL1O43865 530 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 LCP1P13796 627 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 CDK20Q8IZL9 346 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 ZNF398Q8TD17 642 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 Q96MT0 163 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 TCF7L2Q9NQB0 619 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 TBC1D12O60347 775 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 CRTAMO95727 393 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 ZNF507Q8TCN5 953 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 DYNLL2Q96FJ2 89 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 PRKD2Q9BZL6 878 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 FBXO21O94952 628 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 HARS2P49590 506 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 STX4Q12846 297 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 ERFEQ4G0M1 354 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 SPATA17Q96L03 361 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 RNF146Q9NTX7 359 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 SNAP91O60641 907 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 FYNP06241 537 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 TWF1Q12792 350 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 SPASTQ9UBP0 616 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 MYH11P35749 1972 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 AFF2P51816 1311 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 KLHL17Q6TDP4 642 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 RIT2Q99578 217 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 KIFC1Q9BW19 673 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 TEX13BQ9BXU2 312 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 CYP2C9P11712 490 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 RPS6P62753 249 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 USP17L15C9J2P7 530 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 USP17L11C9JVI0 530 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 USP17L18D6R9N7 530 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 USP17L22D6RA61 530 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 USP17L19D6RCP7 530 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 USP17L20D6RJB6 530 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 ARL4DP49703 201 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 USP17L24Q0WX57 530 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 MYBPC2Q14324 1141 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 FAM111AQ96PZ2 611 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 SLIT1O75093 1534 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 E9PBE3 544 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 PIK3CDO00329 1044 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 TMEM26Q6ZUK4 368 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 KBTBD8Q8NFY9 601 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 WDR41Q9HAD4 459 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 CST8O60676 142 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 SLC25A27O95847 323 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 TNFRSF8P28908 595 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 CRABP2P29373 138 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 BTKQ06187 659 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 CHP1Q99653 195 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.63□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 MUC3BQ9H195 1237 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms