RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597589.5

PRKD2-209, Transcript of protein kinase D2, human

TSL 5

Gene PRKD2, Length 1,682 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKD2-209	ENST00000597589	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	USP32	Q8NFA0	1604 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	LTK	P29376	864 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	MED14	O60244	1454 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	33.4	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	33.4	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	SIRT1	Q96EB6	747 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
PRKD2-209	ENST00000597589	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PRKD2-209	ENST00000597589	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PRKD2-209	ENST00000597589	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PRKD2-209	ENST00000597589	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
PRKD2-209	ENST00000597589	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
PRKD2-209	ENST00000597589	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PRKD2-209	ENST00000597589	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PRKD2-209	ENST00000597589	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PRKD2-209	ENST00000597589	CABP2	Q9NPB3	220 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PRKD2-209	ENST00000597589	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PRKD2-209	ENST00000597589	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PRKD2-209	ENST00000597589	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PRKD2-209	ENST00000597589	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PRKD2-209	ENST00000597589	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PRKD2-209	ENST00000597589	PPP2R1A	P30153	589 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PRKD2-209	ENST00000597589	CDK19	Q9BWU1	502 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PRKD2-209	ENST00000597589	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PRKD2-209	ENST00000597589	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PRKD2-209	ENST00000597589	INSR	P06213	1382 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PRKD2-209	ENST00000597589	ADGRB2	O60241	1585 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PRKD2-209	ENST00000597589	NSD2	O96028	1365 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PRKD2-209	ENST00000597589	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		33.2	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.2	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589		A0A1W2PP64	1363 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589	PTCH1	Q13635	1447 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589	ATP7B	P35670	1465 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PRKD2-209	ENST00000597589	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PRKD2-209	ENST00000597589	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PRKD2-209	ENST00000597589	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PRKD2-209	ENST00000597589	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PRKD2-209	ENST00000597589	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.07	■■■□□ 2.89
PRKD2-209	ENST00000597589	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.07	■■■□□ 2.89
PRKD2-209	ENST00000597589	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PRKD2-209	ENST00000597589	CABP1	Q9NZU7	370 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PRKD2-209	ENST00000597589	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PRKD2-209	ENST00000597589	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PRKD2-209	ENST00000597589	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PRKD2-209	ENST00000597589	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PRKD2-209	ENST00000597589	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PRKD2-209	ENST00000597589	AKAP12	Q02952	1782 aa		33.01	■■■□□ 2.88
PRKD2-209	ENST00000597589	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.88
PRKD2-209	ENST00000597589	ITSN1	Q15811	1721 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PRKD2-209	ENST00000597589	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		33	■■■□□ 2.87
PRKD2-209	ENST00000597589	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
PRKD2-209	ENST00000597589	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PRKD2-209	ENST00000597589	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.97	■■■□□ 2.87
PRKD2-209	ENST00000597589	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PRKD2-209	ENST00000597589	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
PRKD2-209	ENST00000597589	FYB1	O15117	783 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PRKD2-209	ENST00000597589	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PRKD2-209	ENST00000597589	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PRKD2-209	ENST00000597589	SHPRH	Q149N8	1683 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PRKD2-209	ENST00000597589	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PRKD2-209	ENST00000597589	KCNA6	P17658	529 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PRKD2-209	ENST00000597589	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PRKD2-209	ENST00000597589	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PRKD2-209	ENST00000597589	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
PRKD2-209	ENST00000597589	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PRKD2-209	ENST00000597589	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PRKD2-209	ENST00000597589	MTHFS	P49914	203 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PRKD2-209	ENST00000597589	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PRKD2-209	ENST00000597589	CFAP53	Q96M91	514 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PRKD2-209	ENST00000597589	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PRKD2-209	ENST00000597589	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PRKD2-209	ENST00000597589	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PRKD2-209	ENST00000597589	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PRKD2-209	ENST00000597589	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PRKD2-209	ENST00000597589	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PRKD2-209	ENST00000597589	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
PRKD2-209	ENST00000597589	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PRKD2-209	ENST00000597589	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	32.77	■■■□□ 2.84
PRKD2-209	ENST00000597589	NEFL	P07196	543 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PRKD2-209	ENST00000597589	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PRKD2-209	ENST00000597589	ACE	P12821	1306 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PRKD2-209	ENST00000597589	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PRKD2-209	ENST00000597589	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PRKD2-209	ENST00000597589	USP6	P35125	1406 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PRKD2-209	ENST00000597589	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
PRKD2-209	ENST00000597589	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.69	■■■□□ 2.82

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