RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 LTKP29376 864 aa39.45■■■■□ 3.91
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa39.43■■■■□ 3.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 SIRT1Q96EB6 747 aa39.43■■■■□ 3.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 NINLQ9Y2I6 1382 aa39.43■■■■□ 3.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 TECPR2O15040 1411 aa39.43■■■■□ 3.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CPS1P31327 1500 aa39.39■■■■□ 3.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM135BQ49AJ0 1406 aa39.39■■■■□ 3.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATAD2Q6PL18 1390 aa39.39■■■■□ 3.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa39.38■■■■□ 3.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 CARD14Q9BXL6 1004 aa39.37■■■■□ 3.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 CABP2Q9NPB3 220 aa39.37■■■■□ 3.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 MED14O60244 1454 aa39.37■■■■□ 3.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa39.34■■■■□ 3.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa39.33■■■■□ 3.89
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DIP2AQ14689 1571 aa39.32■■■■□ 3.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.31■■■■□ 3.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.31■■■■□ 3.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 NSD3Q9BZ95 1437 aa39.3■■■■□ 3.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDK19Q9BWU1 502 aa39.28■■■■□ 3.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBX22Q9Y458 520 aa39.27■■■■□ 3.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPP2R1AP30153 589 aa39.26■■■■□ 3.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZBED9Q6R2W3 1325 aa39.22■■■■□ 3.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 CGNL1Q0VF96 1302 aa39.19■■■■□ 3.86
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC26A8Q96RN1 970 aa39.19■■■■□ 3.86
CTDNEP1-208ENST00000573600 TERF2IPQ9NYB0 399 aa39.18■■■■□ 3.86
CTDNEP1-208ENST00000573600 NSD2O96028 1365 aa39.17■■■■□ 3.86
CTDNEP1-208ENST00000573600 INSRP06213 1382 aa39.17■■■■□ 3.86
CTDNEP1-208ENST00000573600 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.16■■■■□ 3.86
CTDNEP1-208ENST00000573600 WASLO00401 505 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PP64 1363 aa39.15■■■■□ 3.86
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTPRUQ92729 1446 aa39.14■■■■□ 3.86
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADGRB2O60241 1585 aa39.13■■■■□ 3.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.11■■■■□ 3.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD163L1Q9NR16 1453 aa39.11■■■■□ 3.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIK3R4Q99570 1358 aa39.1■■■■□ 3.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTCH1Q13635 1447 aa39.09■■■■□ 3.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP7BP35670 1465 aa39.09■■■■□ 3.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 MORC1Q86VD1 984 aa39.08■■■■□ 3.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa39.08■■■■□ 3.85
CTDNEP1-208ENST00000573600 CABP1Q9NZU7 370 aa39.06■■■■□ 3.84
CTDNEP1-208ENST00000573600 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa39■■■■□ 3.83
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC61Q9Y6R9 512 aa38.95■■■■□ 3.83
CTDNEP1-208ENST00000573600 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAMTS8Q9UP79 889 aa38.89■■■■□ 3.82
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa38.88■■■■□ 3.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 ITSN1Q15811 1721 aa38.88■■■■□ 3.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 FYB1O15117 783 aa38.87■■■■□ 3.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 AKAP12Q02952 1782 aa38.87■■■■□ 3.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR36Q9H6K5 1346 aa38.85■■■■□ 3.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNA6P17658 529 aa38.83■■■■□ 3.81
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.8
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CFAP53Q96M91 514 aa38.79■■■■□ 3.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 MTHFSP49914 203 aa38.77■■■■□ 3.8
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHG3A1L390 1219 aa38.76■■■■□ 3.8
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.75■■■■□ 3.79
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDE3BQ13370 1112 aa38.74■■■■□ 3.79
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUDCQ9Y266 331 aa38.73■■■■□ 3.79
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP38.72■■■■□ 3.79
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa38.68■■■■□ 3.78
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NUTM2FA1L443 756 aa38.63■■■■□ 3.78
CTDNEP1-208ENST00000573600 NALCNQ8IZF0 1738 aa38.63■■■■□ 3.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 USP6P35125 1406 aa38.6■■■■□ 3.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 NGEFQ8N5V2 710 aa38.59■■■■□ 3.77
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