RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570989.1

ITGA3-216, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

Gene ITGA3, Length 2,495 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-216ENST00000570989 SLFN5Q08AF3 891 aa18.79■□□□□ 0.6
ITGA3-216ENST00000570989 PKNOX2Q96KN3 472 aa18.79■□□□□ 0.6
ITGA3-216ENST00000570989 NRXN1Q9ULB1 1477 aa18.79■□□□□ 0.6
ITGA3-216ENST00000570989 PIK3C2BO00750 1634 aa18.78■□□□□ 0.6
ITGA3-216ENST00000570989 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.78■□□□□ 0.6
ITGA3-216ENST00000570989 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
ITGA3-216ENST00000570989 SYNMO15061 1565 aa18.78■□□□□ 0.6
ITGA3-216ENST00000570989 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa18.78■□□□□ 0.6
ITGA3-216ENST00000570989 PPLO60437 1756 aa18.78■□□□□ 0.6
ITGA3-216ENST00000570989 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
ITGA3-216ENST00000570989 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
ITGA3-216ENST00000570989 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.76■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 REREQ9P2R6 1566 aa18.75■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.75■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 MLECQ14165 292 aa18.74■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.74■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 PIK3C2GO75747 1445 aa18.73■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 NLRP1Q9C000 1473 aa18.72■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 IGHDP01880 384 aa18.72■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.72■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.71■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 BCAR3O75815 825 aa18.71■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 POGKQ9P215 609 aa18.71■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa18.71■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 MYOM1P52179 1685 aa18.71■□□□□ 0.59
ITGA3-216ENST00000570989 AGLP35573 1532 aa18.71■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 SEC24BO95487 1268 aa18.7■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa18.7■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.7■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.69■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.68■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.67■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.67■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 RSPH6AQ9H0K4 717 aa18.66■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.66■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 APAF1O14727 1248 aa18.65■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 PLEKHG5O94827 1062 aa18.65■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.65■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 ADGRB1O14514 1584 aa18.65■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 IDI1Q13907 227 aa18.64■□□□□ 0.58
ITGA3-216ENST00000570989 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.64■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 CDCA8Q53HL2 280 aa18.64■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.64■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.64■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 E9PSI1 815 aa18.62■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.62■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 ERVK-7P63135 1459 aa18.62■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.62■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 CGNL1Q0VF96 1302 aa18.62■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.62■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 PDE3AQ14432 1141 aa18.61■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 CLUAP1Q96AJ1 413 aa18.61■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa18.61■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.6■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 BECN1Q14457 450 aa18.59■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 PANK1Q8TE04 598 aa18.59■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 PTPRMP28827 1452 aa18.59■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.59■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ITGA3-216ENST00000570989 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.58■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 COG6Q9Y2V7 657 aa18.58■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 ZFYVE9O95405 1425 aa18.57■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 C3P01024 1663 aa18.57■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.57■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.55■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.55■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.55■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.55■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.53■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 ZMYM3Q14202 1370 aa18.52■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 NGEFQ8N5V2 710 aa18.52■□□□□ 0.56
ITGA3-216ENST00000570989 WWC1Q8IX03 1113 aa18.51■□□□□ 0.55
ITGA3-216ENST00000570989 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.51■□□□□ 0.55
ITGA3-216ENST00000570989 SHPRHQ149N8 1683 aa18.5■□□□□ 0.55
ITGA3-216ENST00000570989 FSD2A1L4K1 749 aa18.5■□□□□ 0.55
ITGA3-216ENST00000570989 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.49■□□□□ 0.55
ITGA3-216ENST00000570989 RLBP1P12271 317 aa18.49■□□□□ 0.55
ITGA3-216ENST00000570989 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
ITGA3-216ENST00000570989 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
ITGA3-216ENST00000570989 TNNQ9UQP3 1299 aa18.49■□□□□ 0.55
ITGA3-216ENST00000570989 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-216ENST00000570989 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-216ENST00000570989 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms