RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC7Q96M83 1385 aa9.99□□□□□ -0.81
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PTPRB-209ENST00000550857 NEO1Q92859 1461 aa9.98□□□□□ -0.81
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PTPRB-209ENST00000550857 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
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PTPRB-209ENST00000550857 NCOA1Q15788 1441 aa9.88□□□□□ -0.83
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