RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526386.5

UBASH3B-203, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 553 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-203ENST00000526386 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 METP08581 1390 aa9.7□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.69□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.69□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 PRAM1Q96QH2 718 aa9.69□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 MRS2Q9HD23 443 aa9.69□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 TBX22Q9Y458 520 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 NLRP13Q86W25 1043 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 EID1Q9Y6B2 187 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 POGKQ9P215 609 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.65□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 CPS1P31327 1500 aa9.65□□□□□ -0.86
UBASH3B-203ENST00000526386 PTPRUQ92729 1446 aa9.65□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 INSRP06213 1382 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 TMC1Q8TDI8 760 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 CDK19Q9BWU1 502 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 CABP2Q9NPB3 220 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 PPP2R1AP30153 589 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 DIP2AQ14689 1571 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 PIK3R4Q99570 1358 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 USP32Q8NFA0 1604 aa9.62□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.61□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 PTCH1Q13635 1447 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 BCANQ96GW7 911 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 NSD2O96028 1365 aa9.6□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 ADGRB2O60241 1585 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 A0A1W2PP64 1363 aa9.59□□□□□ -0.87
UBASH3B-203ENST00000526386 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 CABP1Q9NZU7 370 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 ATP7BP35670 1465 aa9.58□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 FYB1O15117 783 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 MORC1Q86VD1 984 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 KCNA6P17658 529 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-203ENST00000526386 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.52□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.51□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 SSH2Q76I76 1423 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 MTHFSP49914 203 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 TOM1O60784 492 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 AKAP12Q02952 1782 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 NWD1Q149M9 1564 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 PDE3BQ13370 1112 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 NGEFQ8N5V2 710 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 ACEP12821 1306 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-203ENST00000526386 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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