RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa3.83□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 BEGAINQ9BUH8 593 aa3.83□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 RABGEF1Q9UJ41 708 aa3.83□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 CRIPAKQ8N1N5 446 aa3.83□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 BANK1Q8NDB2 785 aa3.83□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 RNF40O75150 1001 aa3.82□□□□□ -1.8
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PDE4D-218ENST00000509368 RAD21O60216 631 aa3.82□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 MCM6Q14566 821 aa3.82□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
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PDE4D-218ENST00000509368 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 SLC16A10Q8TF71 515 aa3.82□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 ARID3AQ99856 593 aa3.82□□□□□ -1.8
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PDE4D-218ENST00000509368 PACS2Q86VP3 889 aa3.81□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 IL21Q9HBE4 155 aa3.81□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 NDUFV2P19404 249 aa3.8□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJB2P25686 324 aa3.8□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 DIXDC1Q155Q3 683 aa3.8□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.8□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 LIMD1Q9UGP4 676 aa3.8□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 CD46P15529 392 aa3.8□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 TERTO14746 1132 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
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PDE4D-218ENST00000509368 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa3.8□□□□□ -1.8
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PDE4D-218ENST00000509368 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
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PDE4D-218ENST00000509368 CTC1Q2NKJ3 1217 aa3.79□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 TUSC1Q2TAM9 212 aa3.79□□□□□ -1.8
PDE4D-218ENST00000509368 SPIRE2Q8WWL2 714 aa3.79□□□□□ -1.8
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PDE4D-218ENST00000509368 PRM3Q9NNZ6 103 aa3.77□□□□□ -1.81
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.77□□□□□ -1.81
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PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
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PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R18Q6NYC8 613 aa3.76□□□□□ -1.81
PDE4D-218ENST00000509368 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP3.76□□□□□ -1.81
PDE4D-218ENST00000509368 POTECB2RU33 542 aa3.76□□□□□ -1.81
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PDE4D-218ENST00000509368 TLL1O43897 1013 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-218ENST00000509368 CLK2P49760 499 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-218ENST00000509368 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-218ENST00000509368 RGS22Q8NE09 1264 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-218ENST00000509368 USTQ9Y2C2 406 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-218ENST00000509368 COG6Q9Y2V7 657 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-218ENST00000509368 COPS2P61201 443 aa3.73□□□□□ -1.81
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