RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473023.1

POLE4-204, Transcript of DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit, human

TSL 5

Gene POLE4, Length 357 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLE4-204	ENST00000473023	NBPF26	B4DH59	902 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	SMAP	O00193	183 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	GPR37	O15354	613 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	FCHSD2	O94868	740 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	PRELP	P51888	382 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	GRIN2B	Q13224	1484 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	NUTM2F	A1L443	756 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	BCAM	P50895	628 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	PTPN5	P54829	565 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	PNMA3	Q9UL41	463 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	NUP160	Q12769	1436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	TOM1	O60784	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	HIC1	Q14526	733 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	ABCC2	Q92887	1545 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLE4-204	ENST00000473023	GRIN2A	Q12879	1464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	LRCH3	Q96II8	777 aa		4.96	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	WBP1L	Q9NX94	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	GNPAT	O15228	680 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	CUX1	P39880	1505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	NCOA1	Q15788	1441 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	UTRN	P46939	3433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	CHD4	Q14839	1912 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	ABCC8	Q09428	1581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	OAT	P04181	439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	FECH	P22830	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	RCCD1	A6NED2	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	DNAJB2	P25686	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	PPP4C	P60510	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	FAM161A	Q3B820	660 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	SOGA1	O94964	1423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	SLF2	Q8IX21	1173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		4.9	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
POLE4-204	ENST00000473023	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	APLP1	P51693	650 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	NECTIN2	Q92692	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	PHOX2B	Q99453	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	LCE2B	O14633	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	SLC10A3	P09131	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	MAP2K5	Q13163	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	C3	P01024	1663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	PCNT	O95613	3336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	RGS12	O14924	1447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	PTPRK	Q15262	1439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	ADAMTS12	P58397	1594 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	IRF6	O14896	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	KCNC4	Q03721	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023		A0A0G2JS52	829 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	SLC4A3	P48751	1232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023		Q6ZNB5	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	MTR	Q99707	1265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	CPS1	P31327	1500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLE4-204	ENST00000473023	ZMYND10	O75800	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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