RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000188167.1

Gm28955-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm28955, Length 2,166 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Spryd3E9Q9B3 442 aa10.24□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Usp35M0QWN7 1009 aa10.24□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Kif3bQ61771 747 aa10.24□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 AglF8VPN4 1532 aa10.23□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Usp47Q8BY87 1376 aa10.23□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Klhl34A2AI76 644 aa10.23□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 BcanQ61361 883 aa10.23□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Dusp27Q148W8 1138 aa10.22□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Nos1Q9Z0J4 1429 aa10.22□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Ptch1Q61115 1434 aa10.21□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa10.21□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Vps37dQ810I0 261 aa10.21□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Klf15Q9EPW2 415 aa10.21□□□□□ -0.77
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Ttc37F8VPK0 1563 aa10.21□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 PtprgQ05909 1442 aa10.2□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Naip5Q9R016 1403 aa10.2□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Kif21bQ9QXL1 1668 aa10.2□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Cd109Q8R422 1442 aa10.2□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Pik3c2gO70167 1506 aa10.19□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Asxl1P59598 1514 aa10.19□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Zfyve27Q3TXX3 415 aa10.19□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Erich4Q3UNU4 136 aa10.19□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Kdm5cP41230 1554 aa10.18□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Clstn1Q9EPL2 979 aa10.18□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Atp10aO54827 1508 aa10.18□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Rgl3Q3UYI5 709 aa10.18□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Ggt6Q6PDE7 497 aa10.18□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Ipo9Q91YE6 1041 aa10.18□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Abca17E9PX95 1733 aa10.17□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 MycnP03966 462 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 ShprhQ7TPQ3 1674 aa10.16□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Atp7aQ64430 1491 aa10.15□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Sema3fO88632 785 aa10.15□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Rsph6aQ8CDR2 708 aa10.15□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Myom3A2ABU4 1439 aa10.15□□□□□ -0.78
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Rnf216P58283 853 aa10.15□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Calr4Q3TQS0 420 aa10.15□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 OptnQ8K3K8 584 aa10.15□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Dip2cE9PWR4 1557 aa10.15□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Yeats2Q3TUF7 1407 aa10.14□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Synj2Q9D2G5 1434 aa10.14□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Nsd2Q8BVE8 1365 aa10.14□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Kiaa0556Q8C753 1610 aa10.14□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Tnnt2P50752 301 aa10.14□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa10.14□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Robo2Q7TPD3 1470 aa10.13□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 RereQ80TZ9 1558 aa10.13□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Gli2Q0VGT2 1544 aa10.13□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Tmco4Q91WU4 631 aa10.13□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Naip6Q9JIB6 1403 aa10.13□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Fndc1E9Q043 1732 aa10.13□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Ms4a5Q810P8 197 aa10.12□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Phf14Q9D4H9 881 aa10.12□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Egfem1Q8C088 590 aa10.11□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Snrnp27Q8K194 155 aa10.11□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Iqcf3Q9D498 203 aa10.11□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 AdgbG3UZ78 1657 aa10.11□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Ttc21bQ0HA38 1315 aa10.11□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa10.11□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Znf710Q3U288 666 aa10.11□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Dot1lQ6XZL8 1540 aa10.11□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Myo5cE9Q1F5 1742 aa10.1□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Plch2A2AP18 1501 aa10.1□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Camsap2Q8C1B1 1461 aa10.1□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Hecw2Q6I6G8 1578 aa10.1□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa10.1□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Rock1P70335 1354 aa10.09□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Znf526Q8BI66 675 aa10.09□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Washc2Q6PGL7 1334 aa10.09□□□□□ -0.79
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Tarbp1E9Q368 1579 aa10.08□□□□□ -0.8
Gm28955-201ENSMUST00000188167 AppP12023 770 aa10.08□□□□□ -0.8
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Plekhg5Q66T02 1073 aa10.08□□□□□ -0.8
Gm28955-201ENSMUST00000188167 R3hcc1Q8BSI6 488 aa10.08□□□□□ -0.8
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Abca6Q8K441 1624 aa10.08□□□□□ -0.8
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Pak3Q61036 559 aa10.08□□□□□ -0.8
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa10.07□□□□□ -0.8
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Arhgap4B1AUY3 965 aa10.07□□□□□ -0.8
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Gm17615E9Q9P2 165 aa10.07□□□□□ -0.8
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Zbtb4Q5F293 982 aa10.07□□□□□ -0.8
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa10.07□□□□□ -0.8
Gm28955-201ENSMUST00000188167 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.9 ms