RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000170957.2

Ggps1-201, Transcript of Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ggps1, Length 4,244 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Hfm1D3Z4R1 1434 aa12.05□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa12.05□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Supt16hQ920B9 1047 aa12.05□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Rnf17Q99MV7 1640 aa12.05□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm10471E9Q1C7 252 aa12.05□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Acsbg1Q99PU5 721 aa12.05□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Ak9G3UYQ4 1894 aa12.05□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Cabp2Q9JLK4 216 aa12.04□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 NhsB1AV60 1647 aa12.04□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Zfyve16Q80U44 1528 aa12.04□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa12.04□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 PalmQ9Z0P4 383 aa12.04□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Nutm1Q8BHP2 1126 aa12.04□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Sirt1Q923E4 737 aa12.03□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Tarbp1E9Q368 1579 aa12.03□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa12.03□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Bcl2l13P59017 434 aa12.03□□□□□ -0.48
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Mcm10Q0VBD2 885 aa12.02□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Zranb3Q6NZP1 1069 aa12.02□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa12.02□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Atxn3Q9CVD2 355 aa12.02□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Dusp27Q148W8 1138 aa12.01□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Usp16Q99LG0 825 aa12.01□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm21698A0A087WQP8 267 aa12.01□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm21671G3UY31 267 aa12.01□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Kcnh8P59111 1102 aa12.01□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 NinlQ6ZQ12 1394 aa12.01□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Nos1Q9Z0J4 1429 aa12.01□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Uggt2E9Q4X2 1504 aa12.01□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Pank1Q8K4K6 548 aa12□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Dnajc5P60904 198 aa12□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Slc12a5Q91V14 1138 aa12□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Chmp5Q9D7S9 219 aa12□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Abca8bQ8K440 1620 aa12□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Myt1Q8CFC2 1127 aa12□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Skint5A7XUY5 1461 aa11.99□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Fndc1E9Q043 1732 aa11.99□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Fam71e1A1L3C1 212 aa11.99□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Plch2A2AP18 1501 aa11.99□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 4933416C03RikQ3V063 378 aa11.99□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Ggnbp2Q5SV77 696 aa11.98□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Swt1Q9DBQ9 907 aa11.98□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa11.98□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Ccne1Q61457 408 aa11.98□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Tmem132eQ6IEE6 982 aa11.98□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 CatipB9EKE5 520 aa11.97□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Map7O88735 730 aa11.97□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Abcc3B2RX12 1523 aa11.97□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gimap6Q8K349 305 aa11.97□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Efcab6Q6P1E8 1516 aa11.97□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Idi2Q8BFZ6 227 aa11.96□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Atp10aO54827 1508 aa11.96□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa11.96□□□□□ -0.49
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Lrrc7Q80TE7 1490 aa11.96□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Fhod3Q76LL6 1578 aa11.95□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa11.95□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 L3mbtl2P59178 703 aa11.95□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Cavin4A2AMM0 362 aa11.95□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Col17a1Q07563 1470 aa11.95□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 InsrP15208 1372 aa11.95□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Hecw1Q8K4P8 1604 aa11.95□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Fmnl2A2APV2 1086 aa11.94□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Chmp7Q8R1T1 451 aa11.94□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Naip7Q9JIB3 1402 aa11.94□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Fam50bQ9WTJ8 334 aa11.94□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gnai1B2RSH2 354 aa11.93□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Idi1P58044 227 aa11.93□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gnai3Q9DC51 354 aa11.93□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Farp2Q91VS8 1065 aa11.93□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Neurl4Q5NCX5 1563 aa11.93□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Kdm5cP41230 1554 aa11.92□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Dot1lQ6XZL8 1540 aa11.92□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 CanxP35564 591 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 PalldQ9ET54 1408 aa11.92□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 TnikP83510 1323 aa11.91□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 HypkQ9CR41 129 aa11.91□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Slain2Q8CI08 581 aa11.9□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Map3k19E9Q3S4 1311 aa11.9□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Fkbp4P30416 458 aa11.9□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Fchsd2Q3USJ8 740 aa11.9□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Zpr1Q62384 459 aa11.9□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Dixdc1Q80Y83 711 aa11.9□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa11.9□□□□□ -0.5
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Plekhh1Q80TI1 1356 aa11.9□□□□□ -0.51
Ggps1-201ENSMUST00000170957 DaxxO35613 739 aa11.89□□□□□ -0.51
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Dip2cE9PWR4 1557 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.6 ms