RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000122421.1

Ccsap-202, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa28.91■■■□□ 2.22
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Nos1Q9Z0J4 1429 aa28.91■■■□□ 2.22
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Pdlim2Q8R1G6 349 aa28.91■■■□□ 2.22
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gas2l2Q5SSG4 860 aa28.9■■■□□ 2.22
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Fndc1E9Q043 1732 aa28.9■■■□□ 2.22
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa28.9■■■□□ 2.22
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Abca8aQ8K442 1620 aa28.89■■■□□ 2.22
Ccsap-202ENSMUST00000122421 DnmbpQ6TXD4 1580 aa28.87■■■□□ 2.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Abca6Q8K441 1624 aa28.87■■■□□ 2.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 KdrP35918 1367 aa28.87■■■□□ 2.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Igf1rQ60751 1373 aa28.86■■■□□ 2.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 AatkQ80YE4 1365 aa28.86■■■□□ 2.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Znf608Q56A10 1511 aa28.85■■■□□ 2.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Fam135bQ9DAI6 1403 aa28.84■■■□□ 2.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa28.84■■■□□ 2.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 GsdmaQ9EST1 446 aa28.84■■■□□ 2.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa28.83■■■□□ 2.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cnga1P29974 684 aa28.83■■■□□ 2.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Uggt1Q6P5E4 1551 aa28.82■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Plcd4Q8K3R3 807 aa28.81■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rlbp1Q9Z275 317 aa28.81■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Iqsec2Q5DU25 1478 aa28.8■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Fgd1P52734 960 aa28.79■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Htatsf1Q8BGC0 757 aa28.79■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa28.78■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Atxn3Q9CVD2 355 aa28.78■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Lemd3Q9WU40 921 aa28.78■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa28.78■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Efcab6Q6P1E8 1516 aa28.78■■■□□ 2.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Trpm1Q2TV84 1622 aa28.76■■■□□ 2.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa28.76■■■□□ 2.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa28.75■■■□□ 2.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 P2rx7Q9Z1M0 595 aa28.73■■■□□ 2.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Hfm1D3Z4R1 1434 aa28.72■■■□□ 2.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Polr3glQ8R0C0 218 aa28.72■■■□□ 2.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Abca9Q8K449 1623 aa28.71■■■□□ 2.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Prex1Q69ZK0 1650 aa28.71■■■□□ 2.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Stag3O70576 1240 aa28.7■■■□□ 2.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 InsrP15208 1372 aa28.7■■■□□ 2.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ksr2Q3UVC0 959 aa28.68■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Atl3Q91YH5 541 aa28.68■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Skint5A7XUY5 1461 aa28.68■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Sptbn5F6UCX4 1208 aa28.68■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Armcx1Q9CX83 456 aa28.68■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gm6268A2A3U9 297 aa28.67■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa28.67■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28.67■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 MaddQ80U28 1577 aa28.66■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 PalldQ9ET54 1408 aa28.65■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa28.65■■■□□ 2.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rabep1O35551 862 aa28.63■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Depdc5P61460 1591 aa28.63■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa28.63■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ipo4Q8VI75 1082 aa28.63■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Adgrl1Q80TR1 1466 aa28.62■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Apaf1O88879 1249 aa28.62■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 IqubQ8CDK3 788 aa28.62■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 ArxO35085 564 aa28.61■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa28.61■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Tsen2Q6P7W5 460 aa28.6■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Pknox2Q8BG99 474 aa28.6■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Trim26Q99PN3 545 aa28.6■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 CenpjQ569L8 1344 aa28.59■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Tecpr2Q3UH45 1423 aa28.58■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ino80Q6ZPV2 1559 aa28.58■■■□□ 2.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Lrrc7Q80TE7 1490 aa28.57■■■□□ 2.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ttc37F8VPK0 1563 aa28.56■■■□□ 2.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa28.55■■■□□ 2.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 AU022751B1B0V2 589 aa28.55■■■□□ 2.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Akap12Q9WTQ5 1684 aa28.54■■■□□ 2.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ift172Q6VH22 1749 aa28.54■■■□□ 2.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Slc52a2Q9D8F3 450 aa28.53■■■□□ 2.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Hecw2Q6I6G8 1578 aa28.53■■■□□ 2.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Hs1bp3Q3TC93 395 aa28.53■■■□□ 2.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Dusp27Q148W8 1138 aa28.51■■■□□ 2.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Arid3cA6PWV5 409 aa28.5■■■□□ 2.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gli2Q0VGT2 1544 aa28.48■■■□□ 2.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cluap1Q8R3P7 413 aa28.48■■■□□ 2.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Map7O88735 730 aa28.48■■■□□ 2.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 OvosQ3UU35 1456 aa28.48■■■□□ 2.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ciz1Q8VEH2 845 aa28.47■■■□□ 2.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa28.47■■■□□ 2.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Nrxn1Q9CS84 1514 aa28.47■■■□□ 2.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Pnmal2G3X9N3 661 aa28.46■■■□□ 2.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7.2 ms