RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AU022751B1B0V2 589 aa28.67■■■□□ 2.18
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atxn3Q9CVD2 355 aa28.65■■■□□ 2.18
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pank1Q8K4K6 548 aa28.64■■■□□ 2.18
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NudcO35685 332 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gli2Q0VGT2 1544 aa28.62■■■□□ 2.17
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 GsdmaQ9EST1 446 aa28.59■■■□□ 2.17
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zmym3Q9JLM4 1370 aa28.59■■■□□ 2.17
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrc7Q80TE7 1490 aa28.54■■■□□ 2.16
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Polr3glQ8R0C0 218 aa28.53■■■□□ 2.16
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Apaf1O88879 1249 aa28.51■■■□□ 2.16
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Akap12Q9WTQ5 1684 aa28.49■■■□□ 2.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim26Q99PN3 545 aa28.48■■■□□ 2.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MaddQ80U28 1577 aa28.48■■■□□ 2.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp10aO54827 1508 aa28.48■■■□□ 2.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zranb1Q7M760 708 aa28.48■■■□□ 2.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rlbp1Q9Z275 317 aa28.48■■■□□ 2.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim58Q5NCC9 485 aa28.47■■■□□ 2.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ak7Q9D2H2 614 aa28.47■■■□□ 2.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa28.47■■■□□ 2.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 DaxxO35613 739 aa28.46■■■□□ 2.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stk26Q99JT2 416 aa28.46■■■□□ 2.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ift172Q6VH22 1749 aa28.46■■■□□ 2.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PrkcshO08795 521 aa28.45■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CenpjQ569L8 1344 aa28.44■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Armcx1Q9CX83 456 aa28.44■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa28.43■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppm1gQ61074 542 aa28.43■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ksr2Q3UVC0 959 aa28.42■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa28.42■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tsen2Q6P7W5 460 aa28.42■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ipo8Q7TMY7 1010 aa28.41■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc52a2Q9D8F3 450 aa28.4■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AdgbG3UZ78 1657 aa28.4■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mroh1E0CZ22 1640 aa28.4■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc183A2AJB1 534 aa28.38■■■□□ 2.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dip2cE9PWR4 1557 aa28.38■■■□□ 2.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AglF8VPN4 1532 aa28.37■■■□□ 2.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp1b4Q99ME6 356 aa28.37■■■□□ 2.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa28.37■■■□□ 2.13
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Knl1Q66JQ7 1612 aa28.36■■■□□ 2.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mre11Q61216 706 aa28.36■■■□□ 2.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28.35■■■□□ 2.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hfm1D3Z4R1 1434 aa28.35■■■□□ 2.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RereQ80TZ9 1558 aa28.34■■■□□ 2.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adgrl1Q80TR1 1466 aa28.33■■■□□ 2.13
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam135bQ9DAI6 1403 aa28.33■■■□□ 2.13
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nrxn1Q9CS84 1514 aa28.3■■■□□ 2.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Shq1Q7TMX5 569 aa28.29■■■□□ 2.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ArxO35085 564 aa28.28■■■□□ 2.12
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Yeats2Q3TUF7 1407 aa28.25■■■□□ 2.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hecw2Q6I6G8 1578 aa28.25■■■□□ 2.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cul9Q80TT8 1865 aa28.25■■■□□ 2.11
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cfap65Q3V0B4 1847 aa28.23■■■□□ 2.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pnmal2G3X9N3 661 aa28.22■■■□□ 2.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmc1Q8R4P5 757 aa28.22■■■□□ 2.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa28.22■■■□□ 2.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ecm2Q5FW85 670 aa28.21■■■□□ 2.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cluap1Q8R3P7 413 aa28.2■■■□□ 2.11
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