RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039744.12

Lnx1-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lnx1, Length 2,727 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Slc4a1apE9PX68 744 aa15.62■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Usp40Q8BWR4 1235 aa15.62■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 P3h3Q8CG70 732 aa15.62■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Znf326O88291 580 aa15.62■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Tpm2P58774 284 aa15.61■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa15.61■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Rims1Q99NE5 1463 aa15.61■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa15.61■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Tmf1B9EKI3 1091 aa15.6■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Irf5P56477 497 aa15.6■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 AU022751B1B0V2 589 aa15.6■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Zscan10Q3URR7 782 aa15.6■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Q7TT23 1179 aa15.6■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa15.6■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 EspnQ9ET47 871 aa15.59■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Pola1P33609 1465 aa15.59■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 PogkQ80TC5 607 aa15.59■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cfap65Q3V0B4 1847 aa15.58■□□□□ 0.09
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Tecpr2Q3UH45 1423 aa15.58■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Trpm1Q2TV84 1622 aa15.58■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 ArxO35085 564 aa15.58■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Efcab6Q6P1E8 1516 aa15.57■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ttc37F8VPK0 1563 aa15.56■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Sbno1Q689Z5 1390 aa15.56■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Lekr1B2RVN1 116 aa15.56■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Fam184bQ0KK56 942 aa15.56■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Clcn1Q64347 994 aa15.56■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa15.56■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ofd1Q80Z25 1017 aa15.55■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ino80Q6ZPV2 1559 aa15.55■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Akap12Q9WTQ5 1684 aa15.55■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Synj2Q9D2G5 1434 aa15.55■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Myom2Q14BI5 1463 aa15.54■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Talpid3E9PV87 1520 aa15.54■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa15.54■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Nphp4P59240 1425 aa15.54■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Dnai1Q8C0M8 701 aa15.53■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Tmem132aQ922P8 1018 aa15.53■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Zscan21Q07231 555 aa15.53■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Knl1Q66JQ7 1612 aa15.53■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Afap1Q80YS6 731 aa15.52■□□□□ 0.08
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Mink1Q9JM52 1308 aa15.51■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Hecw2Q6I6G8 1578 aa15.51■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Skint5A7XUY5 1461 aa15.51■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa15.5■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Mroh1E0CZ22 1640 aa15.49■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Adamts7Q68SA9 1657 aa15.49■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Stag3O70576 1240 aa15.48■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cnga1P29974 684 aa15.48■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Kcnh8P59111 1102 aa15.48■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa15.48■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 DnmbpQ6TXD4 1580 aa15.47■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Dnajc14Q921R4 703 aa15.46■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa15.46■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ppm1gQ61074 542 aa15.46■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Uggt1Q6P5E4 1551 aa15.46■□□□□ 0.07
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa15.46■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Hfm1D3Z4R1 1434 aa15.45■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Tex14Q7M6U3 1450 aa15.45■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 L3mbtl2P59178 703 aa15.45■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Dcaf11Q91VU6 549 aa15.45■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Atp1b4Q99ME6 356 aa15.45■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 BbxQ8VBW5 907 aa15.44■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Stk26Q99JT2 416 aa15.44■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Slc52a2Q9D8F3 450 aa15.44■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Lrrc7Q80TE7 1490 aa15.44■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa15.43■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Kif7B7ZNG0 1348 aa15.43■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Htatsf1Q8BGC0 757 aa15.43■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 PalldQ9ET54 1408 aa15.43■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Esx1O88933 382 aa15.43■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ddrgk1Q80WW9 315 aa15.43■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Samd1D3YXK1 519 aa15.42■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Fbxo2Q80UW2 297 aa15.42■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 AcrbpQ3V140 540 aa15.42■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 IqubQ8CDK3 788 aa15.42■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa15.42■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Shq1Q7TMX5 569 aa15.41■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 NpatQ8BMA5 1420 aa15.41■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 PtprmP28828 1452 aa15.41■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Dnajc5gQ8C632 165 aa15.41■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Qser1A2BIE1 1698 aa15.4■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa15.4■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Plcd3Q8K2J0 785 aa15.38■□□□□ 0.05
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ripk4Q9ERK0 786 aa15.38■□□□□ 0.05
Lnx1-201ENSMUST00000039744 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Lnx1-201ENSMUST00000039744 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa15.37■□□□□ 0.05
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Q9D9H8 365 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.9 ms