RNA–Protein interactions for RNA: YHR171W

ATG7, Transcript of Autophagy-related protein and dual specificity member of the E1 family, yeast

Gene ATG7, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG7	YHR171W	YIL102C	P40488	101 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	IML1	P47170	1584 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	DNF3	Q12674	1656 aa		3	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	ATP18	P81450	59 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	YNL190W	P53872	204 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	DNF2	Q12675	1612 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ATG7	YHR171W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ATG7	YHR171W	APC1	P53886	1748 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ATG7	YHR171W	CDC25	P04821	1589 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ATG7	YHR171W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ATG7	YHR171W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
ATG7	YHR171W	ATP17	Q06405	101 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATG7	YHR171W	VTH1	P40438	1549 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATG7	YHR171W	VTH2	P40890	1549 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATG7	YHR171W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
ATG7	YHR171W	COX7	P10174	60 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ATG7	YHR171W	MMS1	Q06211	1407 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATG7	YHR171W	YMR141C	P40211	102 aa		2.91	□□□□□ -1.94
ATG7	YHR171W	BLM10	P43583	2143 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	SDH6	Q3E785	79 aa		2.89	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	SPO14	P36126	1683 aa		2.89	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	HUA1	P40325	198 aa		2.88	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	RIM15	P43565	1770 aa		2.88	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	RPC10	P40422	70 aa		2.87	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	AUA1	P32450	94 aa		2.86	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		2.86	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	BCK1	Q01389	1478 aa		2.86	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	SSK2	P53599	1579 aa		2.86	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
ATG7	YHR171W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		2.84	□□□□□ -1.96
ATG7	YHR171W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
ATG7	YHR171W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ATG7	YHR171W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ATG7	YHR171W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ATG7	YHR171W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
ATG7	YHR171W	HUB1	Q6Q546	73 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG7	YHR171W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ATG7	YHR171W	YBT1	P32386	1661 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ATG7	YHR171W	PEP1	P32319	1579 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ATG7	YHR171W	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG7	YHR171W	IRC20	Q06554	1556 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG7	YHR171W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG7	YHR171W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ATG7	YHR171W	YOR093C	Q12275	1648 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ATG7	YHR171W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
ATG7	YHR171W	RPL43B	P0CX26	92 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ATG7	YHR171W	VMR1	P38735	1592 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATG7	YHR171W	YBR032W	P38223	100 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG7	YHR171W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG7	YHR171W	ULS1	Q08562	1619 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATG7	YHR171W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ATG7	YHR171W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ATG7	YHR171W	USO1	P25386	1790 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ATG7	YHR171W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ATG7	YHR171W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ATG7	YHR171W	SNF2	P22082	1703 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATG7	YHR171W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATG7	YHR171W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATG7	YHR171W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATG7	YHR171W	HKR1	P41809	1802 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATG7	YHR171W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		2.58	□□□□□ -2
ATG7	YHR171W	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		2.58	□□□□□ -2
ATG7	YHR171W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		2.57	□□□□□ -2
ATG7	YHR171W	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		2.53	□□□□□ -2
ATG7	YHR171W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
ATG7	YHR171W	KOG1	P38873	1557 aa		2.52	□□□□□ -2.01
ATG7	YHR171W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
ATG7	YHR171W	STU1	P38198	1513 aa		2.47	□□□□□ -2.01
ATG7	YHR171W	OLI1	P61829	76 aa		2.45	□□□□□ -2.02
ATG7	YHR171W	NUP192	P47054	1683 aa		2.42	□□□□□ -2.02
ATG7	YHR171W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		2.42	□□□□□ -2.02
ATG7	YHR171W	RKR1	Q04781	1562 aa		2.41	□□□□□ -2.02
ATG7	YHR171W	YBR016W	P38216	128 aa		2.41	□□□□□ -2.02
ATG7	YHR171W	NUP170	P38181	1502 aa		2.39	□□□□□ -2.03
ATG7	YHR171W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
ATG7	YHR171W	YGR025W	P53216	100 aa		2.38	□□□□□ -2.03
ATG7	YHR171W	YBL044W	P38194	122 aa		2.3	□□□□□ -2.04
ATG7	YHR171W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
ATG7	YHR171W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		2.29	□□□□□ -2.04
ATG7	YHR171W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		2.28	□□□□□ -2.04
ATG7	YHR171W	RPS27B	P38711	82 aa		2.28	□□□□□ -2.04
ATG7	YHR171W	SIP18	P50263	79 aa		2.26	□□□□□ -2.05
ATG7	YHR171W	MLP2	P40457	1679 aa		2.25	□□□□□ -2.05

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