RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536159.2

CITED2-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene CITED2, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-202ENST00000536159 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.43■■□□□ 1.18
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CITED2-202ENST00000536159 KRIT1O00522 736 aa22.42■■□□□ 1.18
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CITED2-202ENST00000536159 SASH3O75995 380 aa22.42■■□□□ 1.18
CITED2-202ENST00000536159 SDC4P31431 198 aa22.42■■□□□ 1.18
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CITED2-202ENST00000536159 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.4■■□□□ 1.18
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CITED2-202ENST00000536159 LAG3P18627 525 aa22.4■■□□□ 1.18
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CITED2-202ENST00000536159 DEFB106AQ8N104 65 aa22.39■■□□□ 1.17
CITED2-202ENST00000536159 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.39■■□□□ 1.17
CITED2-202ENST00000536159 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.39■■□□□ 1.17
CITED2-202ENST00000536159 EXD1Q8NHP7 514 aa22.39■■□□□ 1.17
CITED2-202ENST00000536159 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
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CITED2-202ENST00000536159 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
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CITED2-202ENST00000536159 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.39■■□□□ 1.17
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CITED2-202ENST00000536159 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
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CITED2-202ENST00000536159 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.38■■□□□ 1.17
CITED2-202ENST00000536159 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CITED2-202ENST00000536159 SPG21Q9NZD8 308 aa22.38■■□□□ 1.17
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