RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534401.5

PKP3-211, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-211ENST00000534401 PRRX2Q99811 253 aa22.55■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.55■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.55■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 NDST4Q9H3R1 872 aa22.55■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.55■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 GKN1Q9NS71 199 aa22.55■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.55■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.55■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 CKMP06732 381 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 CNGA2Q16280 664 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 VWA3BQ502W6 1294 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 PJA1Q8NG27 643 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 CLDN23Q96B33 292 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 SIX2Q9NPC8 291 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 GMIPQ9P107 970 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 KCNJ18B7U540 433 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 MAN2B1O00754 1011 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 KCNJ12Q14500 433 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 STX1AQ16623 288 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 HECTD3Q5T447 861 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 FOXQ1Q9C009 403 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 CYLDQ9NQC7 956 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 HPS4Q9NQG7 708 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 COCHO43405 550 aa22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 BCAT1P54687 386 aa22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 MTF1Q14872 753 aa22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 STILQ15468 1287 aa22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 PIGZQ86VD9 579 aa22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 PRSS33Q8NF86 280 aa22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.52■■□□□ 1.2
PKP3-211ENST00000534401 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 PLA2G4AP47712 749 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 PDE4CQ08493 712 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 KCNMA1Q12791 1236 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 NCAPHQ15003 741 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 PDGFRLQ15198 375 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 MEA1Q16626 185 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 SCD5Q86SK9 330 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 SCML4Q8N228 414 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 SHC3Q92529 594 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 NMUR1Q9HB89 426 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 OSER1Q9NX31 292 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.195e-7■■■■□ 23.7
PKP3-211ENST00000534401 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 BECN2A8MW95 431 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 LEFTY2O00292 366 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 TULP2O00295 520 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 SETSIPP0DME0 302 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 CD19P15391 556 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 CD72P21854 359 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 PSEN1P49768 467 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 MFAP3P55082 362 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 APBA1Q02410 837 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 TNK2Q07912 1038 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 RUNX3Q13761 415 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 GJB7Q6PEY0 223 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 CHFRQ96EP1 664 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP3-211ENST00000534401 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.5■■□□□ 1.19
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