RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 SCML2Q9UQR0 700 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 SMTNL1A8MU46 457 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 OAS1P00973 400 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 SETSIPP0DME0 302 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 BRD2P25440 801 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 TUBP50607 506 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 PDE4CQ08493 712 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 CNGA2Q16280 664 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 PIGZQ86VD9 579 aa23.15■■□□□ 1.3
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PTPRK-222ENST00000532751 SIX2Q9NPC8 291 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJC12Q9UKB3 198 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRK-222ENST00000532751 COL4A2P08572 1712 aa23.14■■□□□ 1.3
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PTPRK-222ENST00000532751 SYCE3A1L190 88 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 OLFM2O95897 454 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 SLC7A9P82251 487 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 APBA1Q02410 837 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 NCAPHQ15003 741 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 UBA3Q8TBC4 463 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 TFAP2BQ92481 460 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D17Q9HA65 648 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 HEBP1Q9NRV9 189 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 USP3Q9Y6I4 520 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 M0QYV0 167 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 CYP26A1O43174 497 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 MED7O43513 233 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 PLA2G4AP47712 749 aa23.13■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 KCNMA1Q12791 1236 aa23.13■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 MTF1Q14872 753 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF77Q15935 545 aa23.13■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.13■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 SH3RF2Q8TEC5 729 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 SHC3Q92529 594 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ZFYVE19Q96K21 471 aa23.13■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 RNF38Q9H0F5 515 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC4Q9HBW1 653 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 CPQQ9Y646 472 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 MIA3Q5JRA6 1907 aa23.13■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 IER5LQ5T953 404 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 GKN1Q9NS71 199 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 KANSL1LA0AUZ9 987 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 BECN2A8MW95 431 aa23.11■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 COCHO43405 550 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 TLR5O60602 858 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 GLULP15104 373 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF18P17022 549 aa23.11■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 TADA2BQ86TJ2 420 aa23.11■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 MSANTD3Q96H12 275 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ZSWIM1Q9BR11 485 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 CCSER2Q9H7U1 834 aa23.11■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 PIAS3Q9Y6X2 628 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PQH9 124 aa23.1■■□□□ 1.29
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PTPRK-222ENST00000532751 THAP12O43422 761 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 CALCAP01258 141 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 RALAP11233 206 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 IFNAR2P48551 515 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 RAPGEF1Q13905 1077 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 PDGFRLQ15198 375 aa23.1■■□□□ 1.29
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