RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP44Q9H0E7 712 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF696Q9H7X3 374 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ECT2Q9H8V3 914 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIF9Q9HAQ2 790 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYP4F12Q9HCS2 524 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD93Q9NPY3 652 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 HPS4Q9NQG7 708 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZMYM5Q9UJ78 669 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZBED9Q6R2W3 1325 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CROCCQ5TZA2 2017 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GVM2 712 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARL5CA6NH57 179 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 METTL12A8MUP2 240 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 F8W810 466 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7EQS6 105 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MASP2O00187 686 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCAMP1O15126 338 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 NVLO15381 856 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAGEB2O15479 319 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAM12O43184 909 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIGLEC6O43699 453 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 DUX1O43812 170 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRAMEF10O60809 474 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF623O75123 536 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MOSPD3O75425 235 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 RFPL1O75677 317 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFATC1O95644 943 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 JMJD7P0C870 316 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALPPL2P10696 532 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CPB1P15086 417 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARSAP15289 507 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATF2P15336 505 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITGB7P26010 798 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MSX1P28360 303 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GABRR2P28476 465 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 OAS2P29728 719 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDC25CP30307 473 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIF5BP33176 963 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 UGT1A5P35504 534 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GGT5P36269 586 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GGCXP38435 758 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MLH1P40692 756 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNFSF9P41273 254 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNFRSF4P43489 277 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCNN1GP51170 649 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLCN3P51790 818 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITGA1P56199 1179 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ROR1Q01973 937 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 DUSP4Q13115 394 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ORC1Q13415 861 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGL2Q14314 439 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 STARD3Q14849 445 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 VEPH1Q14D04 833 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNNI3KQ59H18 835 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 STXBP5Q5T5C0 1151 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SFMBT2Q5VUG0 894 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 EFCAB12Q6NXP0 572 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 STOX1Q6ZVD7 989 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 RD3Q7Z3Z2 195 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 DSG4Q86SJ6 1040 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITIH5Q86UX2 942 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 KSR1Q8IVT5 923 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCEAL8Q8IYN2 117 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXO39Q8N4B4 442 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 OXR1Q8N573 874 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAMD3Q8N6K7 520 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL22RA1Q8N6P7 574 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL31RAQ8NI17 732 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf216Q8TAB5 229 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 RABGGTAQ92696 567 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms