RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 DMXL1Q9Y485 3027 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 ATP8B3O60423 1300 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 CILPO75339 1184 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 CLSTN1O94985 981 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 P4HA1P13674 534 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 DRD1P21728 446 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 PRCPP42785 496 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 PXNP49023 591 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 ADAM9Q13443 819 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 COBLL1Q53SF7 1204 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 CLEC20AQ6ZU45 233 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 C12orf40Q86WS4 652 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 SFTPA1Q8IWL2 248 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 KIAA1958Q8N8K9 716 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 PDZD8Q8NEN9 1154 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 NIF3L1Q9GZT8 377 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 CCSER2Q9H7U1 834 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 MMRN2Q9H8L6 949 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM8AQ9HCN3 771 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 CFAP97Q9P2B7 532 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 FRYLO94915 3013 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 NFATC1O95644 943 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 ABL1P00519 1130 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 RPL13P26373 211 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 ADORA2BP29275 332 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 TUBP50607 506 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 MAP3K7CLP57077 242 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 LAIR1Q6GTX8 287 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 CYP3A43Q9HB55 503 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 OSER1Q9NX31 292 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 DLL3Q9NYJ7 618 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 DNAH14Q0VDD8 3507 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 TRIM49BA6NDI0 452 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 K7EQS6 105 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 GREM1O60565 184 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 KRT13P13646 458 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 CD58P19256 250 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 GTF2H1P32780 548 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 CNR2P34972 360 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 AMPD2Q01433 879 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 DHCR24Q15392 516 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 FBXO43Q4G163 708 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 CBWD6Q4V339 395 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 CBWD3Q5JTY5 395 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 CBWD5Q5RIA9 395 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 KRT39Q6A163 491 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 RHBDF2Q6PJF5 856 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 PRR23BQ6ZRT6 265 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 PHTF2Q8N3S3 785 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 HHIPQ96QV1 700 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 ARID3AQ99856 593 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 COMMD8Q9NX08 183 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 SPTBN4Q9H254 2564 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 CYP26A1O43174 497 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM200BP0CF97 657 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC6A11P48066 632 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 MXI1P50539 228 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 NUCB2P80303 420 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 HECTD3Q5T447 861 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 ANKRD40Q6AI12 368 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 SYT13Q7L8C5 426 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 USP33Q8TEY7 942 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 CYFIP2Q96F07 1278 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 GSDMAQ96QA5 445 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 NT5C1AQ9BXI3 368 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 IMPG2Q9BZV3 1241 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 NMUR1Q9HB89 426 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 GMEB2Q9UKD1 530 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 E2F8A0AVK6 867 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 TLR5O60602 858 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 ATG13O75143 517 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 TBX18O95935 607 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 RETP07949 1114 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 EPB41P11171 864 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 BMP6P22004 513 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 SPEM2Q0P670 501 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 NR1H3Q13133 447 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 DMC1Q14565 340 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 ERMP1Q7Z2K6 904 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 BBS7Q8IWZ6 715 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC4A11Q8NBS3 891 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 FBXL13Q8NEE6 735 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP2-216ENST00000510193 GAB3Q8WWW8 586 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms