RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 YWHAQP27348 245 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 TNNC1P63316 161 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 NUP93Q8N1F7 819 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 OTUB2Q96DC9 234 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 DPEP3Q9H4B8 488 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 PILRBQ9UKJ0 227 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 TBC1D3BA6NDS4 549 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 CFIP05156 583 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 DLATP10515 647 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 PDCP20941 246 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 ITPKAP23677 461 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 WDR72Q3MJ13 1102 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 PHTF2Q8N3S3 785 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 NAT16Q8N8M0 369 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 RDH13Q8NBN7 331 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 OVCA2Q8WZ82 227 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 HPS3Q969F9 1004 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 FBXO32Q969P5 355 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 B3GNT5Q9BYG0 378 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 TMEM30AQ9NV96 361 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 SLC6A14Q9UN76 642 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa18.49■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 A8MXQ7 604 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 CLDN5O00501 218 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 AP5Z1O43299 807 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 COCHO43405 550 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 HOXD12P35452 270 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 SEMA3BQ13214 749 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 DUOXA1Q1HG43 343 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 SLC36A4Q6YBV0 504 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 NUDT18Q6ZVK8 323 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 HDDC3Q8N4P3 179 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 PDILTQ8N807 584 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 CEP76Q8TAP6 659 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 KCNV2Q8TDN2 545 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 CGRRF1Q99675 332 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 LRRC27Q9C0I9 530 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 DEC1Q9P2X7 70 aa18.48■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 UPK3BL1B0FP48 263 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 UPK3BL2E5RIL1 263 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 HOXD13P35453 343 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 TRPC3Q13507 836 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 PSMD6Q15008 389 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 HECTD3Q5T447 861 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 PIP4P1Q86T03 277 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC127Q96BQ5 260 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 TNMDQ9H2S6 317 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 FSCN3Q9NQT6 498 aa18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 PTPRDP23468 1912 aa18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 ATP8B3O60423 1300 aa18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 TULP3O75386 442 aa18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 RDXP35241 583 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 SLC39A14Q15043 492 aa18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 ANO4Q32M45 955 aa18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 C10orf76Q5T2E6 689 aa18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 DEFB119Q8N690 84 aa18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 SPHK2Q9NRA0 654 aa18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 MSRB2Q9Y3D2 182 aa18.46■□□□□ 0.55
PKDCC-208ENST00000490302 STAU1O95793 577 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PKDCC-208ENST00000490302 SERPINF2P08697 491 aa18.45■□□□□ 0.54
PKDCC-208ENST00000490302 HOXB2P14652 356 aa18.45■□□□□ 0.54
PKDCC-208ENST00000490302 GABRG2P18507 467 aa18.45■□□□□ 0.54
PKDCC-208ENST00000490302 MYL6P60660 151 aa18.45■□□□□ 0.54
PKDCC-208ENST00000490302 CYP24A1Q07973 514 aa18.45■□□□□ 0.54
PKDCC-208ENST00000490302 CUL4AQ13619 759 aa18.45■□□□□ 0.54
PKDCC-208ENST00000490302 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PKDCC-208ENST00000490302 SNX30Q5VWJ9 437 aa18.45■□□□□ 0.54
PKDCC-208ENST00000490302 RABEPKQ7Z6M1 372 aa18.45■□□□□ 0.54
PKDCC-208ENST00000490302 BBS7Q8IWZ6 715 aa18.45■□□□□ 0.54
PKDCC-208ENST00000490302 TERB1Q8NA31 727 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms