RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF77Q15935 545 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF394Q53GI3 561 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 MLKLQ8NB16 471 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXO32Q969P5 355 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 CLDN23Q96B33 292 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 GBP4Q96PP9 640 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 GKN1Q9NS71 199 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 COMMD8Q9NX08 183 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM92AA1XBS5 289 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 OLFM2O95897 454 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 ABL1P00519 1130 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC192P0DO97 292 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 CTHP32929 405 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 SOX9P48436 509 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 RAD23BP54727 409 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 CETN1Q12798 172 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 PDGFRLQ15198 375 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-205ENST00000444916 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC7A9P82251 487 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNH2Q12809 1159 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 LRMPQ12912 555 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 FZD5Q13467 585 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 TTC8Q8TAM2 541 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 LMO3Q8TAP4 145 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 NT5C1BQ96P26 610 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 MED15Q96RN5 788 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 DUSP16Q9BY84 665 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF38Q9H0F5 515 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 EBF3Q9H4W6 596 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 HPS4Q9NQG7 708 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 GMIPQ9P107 970 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 HHLA1C9JL84 531 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 TUBP50607 506 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 RUNX3Q13761 415 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 UBR7Q8N806 425 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 TTC16Q8NEE8 873 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 CPQQ9Y646 472 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 LEFTY2O00292 366 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 CHRNB1P11230 501 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 ARSAP15289 507 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 IFNAR2P48551 515 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 ZXDBP98169 803 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 HECTD3Q5T447 861 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP2A3Q93084 1043 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 IER2Q9BTL4 223 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 CHRDQ9H2X0 955 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 NCDNQ9UBB6 729 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 DACH1Q9UI36 760 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 SCML2Q9UQR0 700 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 COCHO43405 550 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4-205ENST00000444916 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms