RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1QTNF9P0C862 333 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALM1P0DP23 149 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALM2P0DP24 149 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALM3P0DP25 149 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PI3P19957 117 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIFRP42702 1097 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADCY7P51828 1080 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFB103AP81534 67 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD83Q01151 205 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 GHRHRQ02643 423 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 STK3Q13188 491 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPN21Q16825 1174 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCTN1Q2MV58 587 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRR31Q5SQ13 230 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KANK2Q63ZY3 851 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 NFRKBQ6P4R8 1299 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHKBQ93100 1093 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAXDC2Q96IV6 333 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTAGE1Q96RT6 745 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KATNAL1Q9BW62 490 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF114Q9Y508 228 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX14Q9Y5W7 946 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAMTS3O15072 1205 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGA12O60330 932 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 REC8O95072 547 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGBP02675 491 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PFKMP08237 780 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 IQCF3P0C7M6 154 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CKBP12277 381 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ENPP1P22413 925 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS6KB1P23443 525 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPA4P34932 840 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 THPOP40225 353 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNAQP50148 359 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 BFSP2Q13515 415 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT32Q14532 448 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB30Q15771 203 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 VWA3BQ502W6 1294 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF618Q5T7W0 954 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT40Q6A162 431 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 OGFOD2Q6N063 350 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNKSR3Q6P9H4 555 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGMS1Q86VZ5 419 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYSMD2Q8IV50 215 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 FANCBQ8NB91 859 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 AFAP1L1Q8TED9 768 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 GDPD5Q8WTR4 605 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 HERVK_113Q902F9 699 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R16BQ96T49 567 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR20Q99678 358 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 LZTS2Q9BRK4 669 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC26A6Q9BXS9 759 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSTPIP2Q9H939 334 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS54Q9P1Q0 977 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNG1Q9UIX4 513 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHA6Q9UN73 950 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 EDARQ9UNE0 448 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 NID2Q14112 1375 aa5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms