RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417437.6

VNN3-205, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-205ENST00000417437 TMEM120BA0PK00 339 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 DENND3A2RUS2 1198 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 TISP43B9A030 160 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 PSTPIP1O43586 416 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 ATP5HO75947 161 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 FGF18O76093 207 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 OAS1P00973 400 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 CLTAP09496 248 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 LINC00271P0C7V0 271 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 BRAFP15056 766 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 GARTP22102 1010 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 HOXC8P31273 242 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 ELF1P32519 619 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 GATMP50440 423 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 COPS2P61201 443 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 IL9RQ01113 521 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 KRT76Q01546 638 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 GCNT1Q02742 428 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 CYP24A1Q07973 514 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 PDE4CQ08493 712 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 MTMR1Q13613 665 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 GRIK4Q16099 956 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 KYNUQ16719 465 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 DUSP6Q16828 381 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 GALNTL6Q49A17 601 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 ANKRD54Q6NXT1 300 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 TMC7Q7Z402 723 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 SPATA21Q7Z572 469 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 FAM228AQ86W67 206 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 CBWD2Q8IUF1 395 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 GPD1LQ8N335 351 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 CCDC89Q8N998 374 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 MGARPQ8TDB4 240 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 TCP11Q8WWU5 503 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 SAAL1Q96ER3 474 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 MAGEB18Q96M61 343 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 NECTIN4Q96NY8 510 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 TCF25Q9BQ70 676 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.15□□□□□ -1.26
VNN3-205ENST00000417437 CFAP54Q96N23 3096 aa7.15□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 CACNA1BQ00975 2339 aa7.15□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 RRN3P2A6NIE6 340 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 WDR64B1ANS9 1081 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 CDH16O75309 829 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 PROSCO94903 275 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 UBOX5O94941 541 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 GJB6O95452 261 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 ABHD2P08910 425 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 CCND1P24385 295 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 IVDP26440 423 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 TIE1P35590 1138 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 CHKAP35790 457 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 MTHFRP42898 656 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 NPTX2P47972 431 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 CLCN5P51795 746 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 ERVFC1P60507 584 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 NCALDP61601 193 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 GHRHRQ02643 423 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 MGAT3Q09327 533 aa7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
VNN3-205ENST00000417437 BNIP1Q12981 228 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms