RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298282.13

PKNOX2-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX2, Length 3,687 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-201ENST00000298282 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 PDZD7Q9H5P4 517 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 SCOCQ9UIL1 159 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 B4GALT5O43286 388 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 FGFR1P11362 822 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF24P17028 368 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 MARK3P27448 753 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 RCN1Q15293 331 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ISLR2Q6UXK2 745 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 RFX8Q6ZV50 586 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TTC39CQ8N584 583 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 PDGFCQ9NRA1 345 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 PTPN22Q9Y2R2 807 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 A0A0J9YVX5 310 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 STRNO43815 780 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 CILPO75339 1184 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 PENKP01210 267 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ITGAVP06756 1048 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 LYNP07948 512 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 CDKN2BP42772 138 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 C2CD6Q53TS8 623 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 MOB2Q70IA6 237 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 LCA5Q86VQ0 697 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ATG4AQ8WYN0 398 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TCHPQ9BT92 498 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 CETN2P41208 172 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ITGA8P53708 1063 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 PARP6Q2NL67 630 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 OLFML2BQ68BL8 750 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ALLCQ8N6M5 410 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 SDCBP2Q9H190 292 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 INSRRP14616 1297 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ATF2P15336 505 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 RASA2Q15283 850 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 SPON1Q9HCB6 807 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 DERAQ9Y315 318 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 LACTBL1A8MY62 500 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 EPHX2P34913 555 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 CHKAP35790 457 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 CLCN3P51790 818 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 PTPN20Q4JDL3 420 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 DENND1BQ6P3S1 775 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 AFG1LQ8WV93 481 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 PWWP2AQ96N64 755 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.13□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 RASGRF2O14827 1237 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ENDOD1O94919 500 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 STAG3L1P0CL83 205 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 CXCL8P10145 99 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 HARSP12081 509 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TAC1P20366 129 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 CCNA1P78396 465 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 RASIP1Q5U651 963 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF410Q86VK4 478 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TMEM192Q8IY95 271 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 MCEEQ96PE7 176 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 E7ENQ6 273 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 F8VP50 259 aa11.12□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 SUPT3HO75486 399 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms