RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 BTNL10A8MVZ5 291 aa27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 GLUD1P00367 558 aa27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 CLCN4P51793 760 aa27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 SLC6A3Q01959 620 aa27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 PTPROQ16827 1216 aa27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 HFE2Q6ZVN8 426 aa27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 TCEAL8Q8IYN2 117 aa27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF576Q9H609 170 aa27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 PNPLA8Q9NP80 782 aa27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 FBXW11Q9UKB1 542 aa27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 INSL5Q9Y5Q6 135 aa27.42■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 TUFMP49411 452 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 CPNE8Q86YQ8 564 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 NUP93Q8N1F7 819 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 SLC7A14Q8TBB6 771 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 WDR35Q9P2L0 1181 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 EPCAMP16422 314 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 PGFP49763 221 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 GSCP56915 257 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 DAOAP59103 153 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 RBM10P98175 930 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 TWF1Q12792 350 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 LRIT3Q3SXY7 679 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 TRNP1Q6NT89 227 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 BHLHA9Q7RTU4 235 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 RHOT2Q8IXI1 618 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 KREMEN2Q8NCW0 462 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 ANAPC7Q9UJX3 599 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 SCINQ9Y6U3 715 aa27.41■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 SLC38A8A6NNN8 435 aa27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 YJEFN3A6XGL0 299 aa27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 E7ENQ6 273 aa27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 ZBED1O96006 694 aa27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 KRT3P12035 628 aa27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 SNX16P57768 344 aa27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 OGDHQ02218 1023 aa27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 DCUN1D2Q6PH85 259 aa27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 TPCN2Q8NHX9 752 aa27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 FEZF2Q8TBJ5 459 aa27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 UVRAGQ9P2Y5 699 aa27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 SIGLEC16A6NMB1 481 aa27.39■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 FAM149B1Q96BN6 582 aa27.39■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 SPATA17Q96L03 361 aa27.39■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 CNGB3Q9NQW8 809 aa27.39■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 HYOU1Q9Y4L1 999 aa27.39■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 USP3Q9Y6I4 520 aa27.39■■□□□ 1.98
TOMM40-201ENST00000252487 GRID2IPA4D2P6 1211 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 FLT3P36888 993 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 ALDH1A3P47895 512 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 LMAN2LQ9H0V9 348 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 HSFX1Q9UBD0 423 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM59LQ9UK28 342 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 REV3LO60673 3130 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM191CA6NGB0 347 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 MTA2O94776 668 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 FBXO21O94952 628 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 C8AP07357 584 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 NRIP1P48552 1158 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 TCEAL1Q15170 157 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF569Q5MCW4 686 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 MAN1C1Q9NR34 630 aa27.38■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 A0A1W2PPC1 479 aa27.37■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 PALMO75781 387 aa27.37■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 MESDQ14696 234 aa27.37■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 PM20D1Q6GTS8 502 aa27.37■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 SLC26A9Q7LBE3 791 aa27.37■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 SLC22A17Q8WUG5 538 aa27.37■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 PRDM12Q9H4Q4 367 aa27.37■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 TLE6Q9H808 572 aa27.37■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 GMIPQ9P107 970 aa27.37■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 KIF5CO60282 957 aa27.36■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 NYAP1Q6ZVC0 841 aa27.36■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 SLC35F6Q8N357 371 aa27.36■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 SZT2Q5T011 3432 aa27.36■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 YWHAQP27348 245 aa27.36■■□□□ 1.97
TOMM40-201ENST00000252487 GNG11P61952 73 aa27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms