RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc1a2P43006 572 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ripor1Q68FE6 1223 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bpifb9aQ80XI7 591 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tlk1Q8C0V0 766 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nkiras1Q8CEC5 192 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dpp3Q99KK7 738 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mettl16Q9CQG2 553 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rabl3Q9D4V7 236 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr63Q9EQQ3 425 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NumbQ9QZS3 653 aa13.3□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klc2O88448 599 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mmp3P28862 477 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grk1Q9WVL4 564 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kndc1Q0KK55 1742 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp8b5A3FIN4 1183 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3248K7N721 186 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stx7O70439 261 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stra6O70491 670 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serac1Q3U213 654 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mif4gdQ3UBZ5 222 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nlrp4aQ8BU40 982 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8CD60 292 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tldc1Q8K0P3 455 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Yaf2Q99LW6 179 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 XpotQ9CRT8 963 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem39aQ9CYC3 486 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Polr3hQ9D2C6 204 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Raph1F2Z3U3 1266 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ZfaP23607 742 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtmr10Q7TPM9 771 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1057Q7TR75 315 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zdhhc17Q80TN5 632 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc22Q8C159 568 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rps6kl1Q8R2S1 544 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1353Q8VGU8 309 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snrnp25Q8VIK1 123 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdk9Q99J95 372 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc39a3Q99K24 317 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgef25Q9CWR0 618 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rfc5Q9D0F6 339 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ten1Q9D7K2 161 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chit1Q9D7Q1 464 aa13.29□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prom1O54990 867 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 WapP01173 134 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stk40Q7TNL3 435 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc1Q80VQ1 524 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpa1Q8VEE4 623 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tssk3Q9D2E1 268 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adrm1Q9JKV1 407 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DgkeQ9R1C6 564 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb18Q9WUK6 522 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kat6bQ8BRB7 1872 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm29554A0A087WNW4 188 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2b13A6H6J2 491 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc4a9E9PUP3 929 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Apold1E9Q0X2 246 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ess2O70279 479 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sox8Q04886 464 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adad1Q5SUE7 619 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Iars2Q8BIJ6 1012 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Afap1l1Q8BZI0 768 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actl7aQ9QY84 440 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ssxb9A2BI93 185 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdk14O35495 469 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc12a1P55014 1095 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IdsQ08890 552 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdm7aQ3UWM4 940 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pick1Q62083 416 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mettl25Q6NXH8 597 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elmo2Q8BHL5 732 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sugt1Q9CX34 336 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LrmdaQ9D9B4 229 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Skint6A7XUZ6 1240 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpind1P49182 478 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phactr1Q2M3X8 580 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Alg9Q8VDI9 611 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rem2Q8VEL9 341 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rwdd4Q9CPR1 188 aa13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhdc7aA2APT9 773 aa13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rplp2P99027 115 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem120bQ3TA38 339 aa13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pard6bQ9JK83 371 aa13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nccrp1G3X9C2 266 aa13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Far2Q7TNT2 515 aa13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdm4bQ91VY5 1086 aa13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem132aQ922P8 1018 aa13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RpgrQ9R0X5 1001 aa13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap4b1Q9WV76 738 aa13.27□□□□□ -0.28
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scgb2b19J3QM75 112 aa13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.7 ms