Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,76■■■■□ 3,64
Stx7O70439 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Stx7O70439 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Stx7O70439 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Stx7O70439 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Stx7O70439 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,34■■■□□ 2,93
Stx7O70439 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,01■■■□□ 2,87
Stx7O70439 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,61■■■□□ 2,81
Stx7O70439 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,54■■■□□ 2,8
Stx7O70439 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Stx7O70439 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Stx7O70439 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Stx7O70439 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Stx7O70439 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Stx7O70439 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Stx7O70439 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,55■■■□□ 2,64
Stx7O70439 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Stx7O70439 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Stx7O70439 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Stx7O70439 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Stx7O70439 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Stx7O70439 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Stx7O70439 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Stx7O70439 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Stx7O70439 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Stx7O70439 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Stx7O70439 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Stx7O70439 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Stx7O70439 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Stx7O70439 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,62■■■□□ 2,49
Stx7O70439 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Stx7O70439 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Stx7O70439 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Stx7O70439 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Stx7O70439 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Stx7O70439 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Stx7O70439 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Stx7O70439 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Stx7O70439 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Stx7O70439 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Stx7O70439 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Stx7O70439 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Stx7O70439 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Stx7O70439 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Stx7O70439 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Stx7O70439 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Stx7O70439 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Stx7O70439 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Stx7O70439 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Stx7O70439 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Stx7O70439 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Stx7O70439 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Stx7O70439 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Stx7O70439 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Stx7O70439 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Stx7O70439 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Stx7O70439 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Stx7O70439 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Stx7O70439 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Stx7O70439 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Stx7O70439 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Stx7O70439 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Stx7O70439 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Stx7O70439 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Stx7O70439 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Stx7O70439 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Stx7O70439 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Stx7O70439 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Stx7O70439 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Stx7O70439 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Stx7O70439 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Stx7O70439 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Stx7O70439 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Stx7O70439 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Stx7O70439 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Stx7O70439 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Stx7O70439 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Stx7O70439 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Stx7O70439 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Stx7O70439 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Stx7O70439 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Stx7O70439 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Stx7O70439 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Stx7O70439 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Stx7O70439 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Stx7O70439 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Stx7O70439 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Stx7O70439 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Stx7O70439 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Stx7O70439 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Stx7O70439 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Stx7O70439 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Stx7O70439 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Stx7O70439 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Stx7O70439 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Stx7O70439 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Stx7O70439 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Stx7O70439 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Stx7O70439 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Stx7O70439 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms