Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
Mmp3P28862 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Mmp3P28862 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Mmp3P28862 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Mmp3P28862 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Mmp3P28862 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Mmp3P28862 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Mmp3P28862 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Mmp3P28862 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Mmp3P28862 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Mmp3P28862 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Mmp3P28862 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Mmp3P28862 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Mmp3P28862 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Mmp3P28862 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Mmp3P28862 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Mmp3P28862 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Mmp3P28862 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Mmp3P28862 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Mmp3P28862 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Mmp3P28862 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Mmp3P28862 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Mmp3P28862 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Mmp3P28862 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Mmp3P28862 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Mmp3P28862 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Mmp3P28862 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Mmp3P28862 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Mmp3P28862 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Mmp3P28862 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Mmp3P28862 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Mmp3P28862 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Mmp3P28862 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Mmp3P28862 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Mmp3P28862 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Mmp3P28862 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Mmp3P28862 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Mmp3P28862 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Mmp3P28862 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Mmp3P28862 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Mmp3P28862 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Mmp3P28862 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Mmp3P28862 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Mmp3P28862 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Mmp3P28862 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Mmp3P28862 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Mmp3P28862 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Mmp3P28862 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Mmp3P28862 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Mmp3P28862 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Mmp3P28862 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Mmp3P28862 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Mmp3P28862 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Mmp3P28862 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Mmp3P28862 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Mmp3P28862 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Mmp3P28862 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Mmp3P28862 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Mmp3P28862 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Mmp3P28862 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Mmp3P28862 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Mmp3P28862 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Mmp3P28862 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Mmp3P28862 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Mmp3P28862 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Mmp3P28862 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Mmp3P28862 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mmp3P28862 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Mmp3P28862 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Mmp3P28862 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Mmp3P28862 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Mmp3P28862 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Mmp3P28862 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Mmp3P28862 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Mmp3P28862 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Mmp3P28862 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Mmp3P28862 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Mmp3P28862 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Mmp3P28862 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Mmp3P28862 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Mmp3P28862 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Mmp3P28862 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Mmp3P28862 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Mmp3P28862 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Mmp3P28862 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Mmp3P28862 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Mmp3P28862 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Mmp3P28862 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Mmp3P28862 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Mmp3P28862 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Mmp3P28862 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Mmp3P28862 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Mmp3P28862 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Mmp3P28862 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Mmp3P28862 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Mmp3P28862 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Mmp3P28862 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Mmp3P28862 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Mmp3P28862 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Mmp3P28862 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms