RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C DNF3Q12674 1656 aa0.61□□□□□ -2.31
YFR056CYFR056C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YFR056CYFR056C RIM15P43565 1770 aa0.6□□□□□ -2.31
YFR056CYFR056C RPA12P32529 125 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
YFR056CYFR056C PAU4P53427 120 aa0.6□□□□□ -2.31
YFR056CYFR056C YGL194C-AQ2V2P6 80 aa0.6□□□□□ -2.31
YFR056CYFR056C YMR175W-AQ3E766 64 aa0.59□□□□□ -2.31
YFR056CYFR056C TY1B-BLQ12490 1755 aa0.58□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C BSC4P53841 131 aa0.58□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C YNL190WP53872 204 aa0.58□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C YOL164W-AQ3E7A5 60 aa0.58□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C MHF2Q3E829 80 aa0.58□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C NHP2P32495 156 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C RPS29BP41058 56 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C SCP1Q08873 200 aa0.57□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa0.57□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C TY1B-BRQ12193 1756 aa0.57□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C COX7P10174 60 aa0.55□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C Q0032Q9ZZX7 96 aa0.55□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C RPC10P40422 70 aa0.54□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa0.54□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C PDX3P38075 228 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C YMR122W-AQ3E842 84 aa0.53□□□□□ -2.32
YFR056CYFR056C YNL198CP40166 100 aa0.52□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C RPL38P49167 78 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C YOR343CQ12484 108 aa0.52□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C ESP1Q03018 1630 aa0.52□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C YAL065CO13511 128 aa0.51□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C BLM10P43583 2143 aa0.51□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C POC4Q12245 148 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa0.5□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa0.5□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa0.5□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-MR1Q04214 1755 aa0.5□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-NL1Q12112 1755 aa0.5□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-GR1Q12141 1755 aa0.5□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-GR3Q12316 1755 aa0.5□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-ORQ92393 1755 aa0.5□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C YHR214C-DP0CX93 97 aa0.49□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C FPR2P32472 135 aa0.49□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C PAU23Q07987 124 aa0.49□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C PAU17Q12370 124 aa0.49□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C YCR085WP25650 117 aa0.48□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TOM6P33448 61 aa0.48□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C CWP2P43497 92 aa0.48□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C FAS2P19097 1887 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C MMS22Q06164 1454 aa0.48□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C YJR107C-AP0CT86 78 aa0.47□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C YBR016WP38216 128 aa0.47□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C ATP18P81450 59 aa0.47□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C YIL156W-BQ2V2P4 73 aa0.47□□□□□ -2.33
YFR056CYFR056C ECM29P38737 1868 aa0.46□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa0.45□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C TY1B-ER2Q03619 1755 aa0.45□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C TY1B-DR1Q03855 1755 aa0.45□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C TY1B-GR2Q12269 1755 aa0.45□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C YPR145C-AQ2V2P0 78 aa0.45□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C TY1B-DR3Q99231 1755 aa0.45□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C YFR009W-AP0C5M9 85 aa0.44□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C HKR1P41809 1802 aa0.43□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C YOR105WQ08504 108 aa0.43□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C YOR314WQ12506 109 aa0.43□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C YKL065W-AQ2V2P2 73 aa0.43□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C SDH6Q3E785 79 aa0.43□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C YKL068W-AQ3E826 78 aa0.43□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C MOT1P32333 1867 aa0.43□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C TY1B-JR1P47098 1755 aa0.42□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C TY1B-ER1Q03612 1755 aa0.42□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C TY1B-OLQ12273 1755 aa0.42□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C YDR381C-AQ3E6R5 114 aa0.42□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C SIN3P22579 1536 aa0.42□□□□□ -2.34
YFR056CYFR056C YDL022C-AP0C5L6 82 aa0.4□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C SGF11Q03067 99 aa0.4□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa0.4□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C STT4P37297 1900 aa0.4□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa0.39□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C YGR121W-AQ3E816 71 aa0.39□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C TY2B-CP25384 1770 aa0.39□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C TY2B-DR1Q12472 1770 aa0.39□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C ATX1P38636 73 aa0.38□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C EDC1P53080 175 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C YIL134C-AQ45U18 67 aa0.38□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C SWM2P40342 146 aa0.37□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C YDR119W-AQ2V2P9 66 aa0.37□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C TAO3P40468 2376 aa0.37□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
YFR056CYFR056C YBR032WP38223 100 aa0.36□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.9 ms