RNA–Protein interactions for RNA: YBL018C

POP8, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP8, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP8	YBL018C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		0.36	□□□□□ -2.35
POP8	YBL018C	SRB8	P25648	1427 aa		0.36	□□□□□ -2.35
POP8	YBL018C	YOR093C	Q12275	1648 aa		0.35	□□□□□ -2.35
POP8	YBL018C	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		0.35	□□□□□ -2.35
POP8	YBL018C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
POP8	YBL018C	TSC11	P40061	1430 aa		0.35	□□□□□ -2.35
POP8	YBL018C	RPO31	P04051	1460 aa		0.35	□□□□□ -2.35
POP8	YBL018C	LTE1	P07866	1435 aa		0.34	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	SSN2	P38931	1420 aa		0.34	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	RSM18	P40033	138 aa		0.34	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	MMS1	Q06211	1407 aa		0.34	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		0.33	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	MIX14	Q04341	121 aa		0.33	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YDR029W	Q12111	104 aa		0.33	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	MHF2	Q3E829	80 aa		0.33	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		0.33	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.33	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	RSF2	P46974	1380 aa		0.32	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YNL198C	P40166	100 aa		0.32	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	CDC25	P04821	1589 aa		0.32	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YBR292C	P38357	123 aa		0.31	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YHL005C	P38752	130 aa		0.31	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	AIM19	P40502	157 aa		0.31	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		0.31	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	DNF2	Q12675	1612 aa		0.31	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YRF1-2	P40105	1681 aa		0.3	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		0.3	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		0.3	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	FPR2	P32472	135 aa		0.3	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		0.3	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.3	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		0.3	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	PEP1	P32319	1579 aa		0.3	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	NTE1	Q04958	1679 aa		0.3	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	CAT8	P39113	1433 aa		0.3	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	PDR11	P40550	1411 aa		0.3	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	BSC4	P53841	131 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	SGF11	Q03067	99 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YDR042C	Q03205	200 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	PAU23	Q07987	124 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	SCP1	Q08873	200 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	PAU17	Q12370	124 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	BUD4	P47136	1447 aa		0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	ECM12	O13529	151 aa		0.28	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		0.28	□□□□□ -2.36
POP8	YBL018C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	ATX1	P38636	73 aa		0.27	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		0.27	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	YAL065C	O13511	128 aa		0.26	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	COX7	P10174	60 aa		0.26	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	TOM6	P33448	61 aa		0.26	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	SDH6	Q3E785	79 aa		0.26	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		0.26	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	SSK2	P53599	1579 aa		0.25	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		0.25	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	CWP2	P43497	92 aa		0.25	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	ATP18	P81450	59 aa		0.25	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	POL1	P13382	1468 aa		0.24	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	YBR016W	P38216	128 aa		0.24	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	YOR105W	Q08504	108 aa		0.24	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		0.23	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	YMR082C	Q04276	118 aa		0.22	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.22	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		0.22	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	HAP1	P0CE41	1502 aa		0.22	□□□□□ -2.37
POP8	YBL018C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		0.21	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		0.21	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	GDB1	Q06625	1536 aa		0.2	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	YCR085W	P25650	117 aa		0.2	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	YOR343C	Q12484	108 aa		0.2	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	BCK1	Q01389	1478 aa		0.2	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	YBR032W	P38223	100 aa		0.19	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		0.19	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	YCR108C	Q3E819	63 aa		0.19	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	GCN2	P15442	1659 aa		0.18	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	DOP1	Q03921	1698 aa		0.18	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		0.18	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		0.18	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	VPS15	P22219	1454 aa		0.17	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	PDR10	P51533	1564 aa		0.17	□□□□□ -2.38
POP8	YBL018C	RKR1	Q04781	1562 aa		0.17	□□□□□ -2.38

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