RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ARID2	Q68CP9	1835 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	CCL23	P55773	120 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	RAET1E	Q8TD07	263 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SH3GL2	Q99962	352 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SNX25	Q9H3E2	840 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM165	Q9HC07	324 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC3	P53804	2025 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	PASK	Q96RG2	1323 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232		E5RJQ4	531 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	RECQL4	O94761	1208 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	GZMA	P12544	262 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	P4HA1	P13674	534 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MAN1A1	P33908	653 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MLH1	P40692	756 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	CLDN10	P78369	228 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	CDC42EP1	Q00587	391 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	P3H1	Q32P28	736 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	JAML	Q86YT9	394 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	DPP3	Q9NY33	737 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MCM8	Q9UJA3	840 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	B4GALT4	O60513	344 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ATF2	P15336	505 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	TM4SF4	P48230	202 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ARSE	P51690	589 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	RSPH3	Q86UC2	560 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ABLIM1	O14639	778 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF3C	O14782	793 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	APRT	P07741	180 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	KIT	P10721	976 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	PROZ	P22891	400 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	FNTA	P49354	379 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SPARCL1	Q14515	664 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ISCU	Q9H1K1	167 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	AXIN1	O15169	862 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	TOMM70	O94826	608 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	PRLR	P16471	622 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	NDUFV1	P49821	464 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MAP3K7CL	P57077	242 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	OLIG2	Q13516	323 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MIB1	Q86YT6	1006 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	TRPV1	Q8NER1	839 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	USP6NL	Q92738	828 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SYT11	Q9BT88	431 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	NACA2	Q9H009	215 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ASB7	Q9H672	318 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNK1	O00180	336 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM189A1	O60320	539 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	HSD17B3	P37058	310 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	RBP5	P82980	135 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SKOR1	P84550	965 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ENPEP	Q07075	957 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MYO1E	Q12965	1108 aa		10.28	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms