RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580828.1

SNHG25-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 25, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG25, Length 106 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG25-201ENST00000580828 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
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SNHG25-201ENST00000580828 COL4A2P08572 1712 aa12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 TNFRSF10BO14763 440 aa12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 AP1G2O75843 785 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNHG25-201ENST00000580828 TXNDC11Q6PKC3 985 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNHG25-201ENST00000580828 SPEM1Q8N4L4 309 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNHG25-201ENST00000580828 OSCP1Q8WVF1 389 aa12.89□□□□□ -0.35
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SNHG25-201ENST00000580828 ATP2A3Q93084 1043 aa12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 KCNK16Q96T55 309 aa12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
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SNHG25-201ENST00000580828 MMRN2Q9H8L6 949 aa12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 HPS4Q9NQG7 708 aa12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 RAB20Q9NX57 234 aa12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 MAN1B1Q9UKM7 699 aa12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 GREB1Q4ZG55 1949 aa12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 FAM92AA1XBS5 289 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 CILPO75339 1184 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 OLFM2O95897 454 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 ABL1P00519 1130 aa12.88□□□□□ -0.35
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SNHG25-201ENST00000580828 FAM200BP0CF97 657 aa12.88□□□□□ -0.35
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SNHG25-201ENST00000580828 CCR3P51677 355 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 PMS1P54277 932 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 NRLP54845 237 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 NR1H3Q13133 447 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 CCINQ13939 588 aa12.88□□□□□ -0.35
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SNHG25-201ENST00000580828 SNX30Q5VWJ9 437 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 CPA6Q8N4T0 437 aa12.88□□□□□ -0.35
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SNHG25-201ENST00000580828 ATRIPQ8WXE1 791 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 NELL1Q92832 810 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 SEMA4DQ92854 862 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 FBXO32Q969P5 355 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 CYFIP2Q96F07 1278 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 CEP63Q96MT8 703 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 SMOQ99835 787 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 FBXO44Q9H4M3 255 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 KRT82Q9NSB4 513 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 ZSCAN32Q9NX65 697 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 CHMP5Q9NZZ3 219 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 HMGXB4Q9UGU5 601 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 COQ4Q9Y3A0 265 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 R4GN57 208 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 OBSL1O75147 1896 aa12.88□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 SPTBN4Q9H254 2564 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 OAS1P00973 400 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 ARSAP15289 507 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 CD58P19256 250 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 CXCL12P48061 93 aa12.87□□□□□ -0.35
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SNHG25-201ENST00000580828 SLC5A3P53794 718 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 ORC1Q13415 861 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 MORC3Q14149 939 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 PON2Q15165 354 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 EML3Q32P44 896 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 TMEM196Q5HYL7 178 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 HECTD3Q5T447 861 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 TRIM68Q6AZZ1 485 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 ZBTB44Q8NCP5 570 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 SCAMP5Q8TAC9 235 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 WHAMMQ8TF30 809 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 TWNKQ96RR1 684 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 RNF38Q9H0F5 515 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 ECT2Q9H8V3 914 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 PNPLA8Q9NP80 782 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 FAM49BQ9NUQ9 324 aa12.87□□□□□ -0.35
SNHG25-201ENST00000580828 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
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