RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF77Q15935 545 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ISM2Q6H9L7 571 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTI2Q6NXR4 508 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC2A14Q8TDB8 520 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC35C1Q96A29 364 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFYVE19Q96K21 471 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 GKN1Q9NS71 199 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL37Q9NZH6 218 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 HMGXB4Q9UGU5 601 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO4Q9UKT5 387 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM92AA1XBS5 289 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2orf78A6NCI8 922 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNFRSF10BO14763 440 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 PMM2O15305 246 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAMTOR5O43504 91 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNA14O95837 355 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM200BP0CF97 657 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC130P13994 396 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTHP32929 405 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC5A3P53794 718 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC32Q14392 662 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTF1Q14872 753 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF528Q3MIS6 628 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CBWD6Q4V339 395 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CBWD3Q5JTY5 395 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CBWD5Q5RIA9 395 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 NELFBQ8WX92 580 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEMA4DQ92854 862 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC22A12Q96S37 553 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP2S1Q96SQ9 504 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNK16Q96T55 309 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHRDQ9H2X0 955 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO44Q9H4M3 255 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 PNPLA8Q9NP80 782 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 GTSE1Q9NYZ3 720 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA1468Q9P260 1216 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 OLFM2O95897 454 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 OAS1P00973 400 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD58P19256 250 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 TUBP50607 506 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC7A9P82251 487 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXK2Q01167 660 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAK1Q13153 545 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 FZD5Q13467 585 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 RUNX3Q13761 415 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC40Q4G0X9 1142 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 DGKKQ5KSL6 1271 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNX30Q5VWJ9 437 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHL10Q6JEL2 608 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 C12orf29Q8N999 325 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 WHAMMQ8TF30 809 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 OSCP1Q8WVF1 389 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP2A3Q93084 1043 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO32Q969P5 355 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 EXOC4Q96A65 974 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYFIP2Q96F07 1278 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 TWNKQ96RR1 684 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMOQ99835 787 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEMA4AQ9H3S1 761 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.493e-10■■■■■ 57.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 CISHQ9NSE2 258 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM49BQ9NUQ9 324 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 PATJQ8NI35 1801 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 HELZP42694 1942 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 BIN1O00499 593 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 P4HA2O15460 535 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNK2Q07912 1038 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CETN1Q12798 172 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ORC1Q13415 861 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP2R5DQ14738 602 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLEC17AQ6ZS10 378 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYNPOQ8N3V7 929 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPA6Q8N4T0 437 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SH3RF2Q8TEC5 729 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 HPS4Q9NQG7 708 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTNND2Q9UQB3 1225 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SP9P0CG40 484 aa18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHRNB1P11230 501 aa18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOX9P48436 509 aa18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFNAR2P48551 515 aa18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 FMO5P49326 533 aa18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 MARSP56192 900 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP3K7CLP57077 242 aa18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIN3Q8TB24 985 aa18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 EBF3Q9H4W6 596 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.2 ms