RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 RRAGAQ7L523 313 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 PRSS33Q8NF86 280 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 FBXO32Q969P5 355 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 DUSP16Q9BY84 665 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 THAP9Q9H5L6 903 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 MBD3O95983 291 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 ABL1P00519 1130 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 PGFP49763 221 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 ZXDBP98169 803 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 TNK2Q07912 1038 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 RNF38Q9H0F5 515 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 COMMD8Q9NX08 183 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 GMIPQ9P107 970 aa20.17■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 OLFM2O95897 454 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 GCNT1Q02742 428 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 ZNF77Q15935 545 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 PJA1Q8NG27 643 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 TTC8Q8TAM2 541 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 GKN1Q9NS71 199 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.16■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 GLULP15104 373 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 PFKLP17858 780 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 SOX9P48436 509 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 PLCB2Q00722 1185 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 TCF15Q12870 199 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 USP4Q13107 963 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 TMEM270Q6UE05 265 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 TTC30AQ86WT1 665 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 TTC16Q8NEE8 873 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 KCNH6Q9H252 994 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 HPS4Q9NQG7 708 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.15■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 MUC6Q6W4X9 2439 aa20.14■□□□□ 0.82
EDC3-211ENST00000566243 CYP26A1O43174 497 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 CALCAP01258 141 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 CD19P15391 556 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 SLC9A1P19634 815 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 PDE6CP51160 858 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 SLC7A9P82251 487 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 APBA1Q02410 837 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 MTF1Q14872 753 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 SGO2Q562F6 1265 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 TFAP2BQ92481 460 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 SCML2Q9UQR0 700 aa20.14■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 FAM170BA6NMN3 283 aa20.13■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 TULP2O00295 520 aa20.13■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 O00370 1275 aa20.13■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 COCHO43405 550 aa20.13■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 VDRP11473 427 aa20.13■□□□□ 0.81
EDC3-211ENST00000566243 ARSAP15289 507 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms