RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540240.1

C16orf62-212, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-212ENST00000540240 CD8BP10966 210 aa8.37□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 TDGF1P13385 188 aa8.37□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 KCNE1P15382 129 aa8.37□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 CEBPBP17676 345 aa8.37□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ITPKAP23677 461 aa8.37□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.37□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.37□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.37□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 SEC24AO95486 1093 aa8.36□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 FAM87AP0C7U9 286 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 MCF2P10911 925 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 CHRNB1P11230 501 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 EPHA5P54756 1037 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ORC1Q13415 861 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 GRM2Q14416 872 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 PDIA5Q14554 519 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 CSRP2Q16527 193 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 VITQ6UXI7 678 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 GTF3C6Q969F1 213 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 TCHPQ9BT92 498 aa8.36□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.36□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ASAH2Q9NR71 780 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 CFAP54Q96N23 3096 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 VWA8A3KMH1 1905 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 NOTCH4Q99466 2003 aa8.36□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 KRT37O76014 449 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 EDN1P05305 212 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 MYL4P12829 197 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 PAX3P23760 479 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 CCNE1P24864 410 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 HOXA6P31267 233 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 MCM4P33991 863 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 PEX3P56589 373 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 TWF1Q12792 350 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 ECM1Q16610 540 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ME3Q16798 604 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ST3GAL2Q16842 350 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.35□□□□□ -1.07
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C16orf62-212ENST00000540240 HAUS6Q7Z4H7 955 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 LONP2Q86WA8 852 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 DRC1Q96MC2 740 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 TIPINQ9BVW5 301 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 CDT1Q9H211 546 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-212ENST00000540240 OBP2AQ9NY56 170 aa8.35□□□□□ -1.07
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