RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 PRODHO43272 600 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ORC4O43929 436 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CYP2D6P10635 497 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 HOXC13P31276 330 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 ACVR2BQ13705 512 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 PPP2R5BQ15173 497 aa8.49□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 KBTBD2Q8IY47 623 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.49□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.49□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 ZNF304Q9HCX3 659 aa8.49□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa8.49□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 H0Y3Z8 333 aa8.48□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 IDEP14735 1019 aa8.48□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 CFAP58Q5T655 872 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 KATNBL1Q9H079 304 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 PIF1Q9H611 641 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.48□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 SNX16P57768 344 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 GPR85P60893 370 aa8.47□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 LCORLQ8N3X6 602 aa8.47□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 CHST13Q8NET6 341 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.47□□□□□ -1.05
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LMO3-212ENST00000535535 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 NUDT11Q96G61 164 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CCDC17Q96LX7 622 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TNNQ9UQP3 1299 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 C5orf42Q9H799 3197 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ASTN1O14525 1302 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 GRIN2DO15399 1336 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 FAM170AA1A519 330 aa8.46□□□□□ -1.05
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