RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.19■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 EBF1Q9UH73 591 aa22.19■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 INVSQ9Y283 1065 aa22.19■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 CLDN5O00501 218 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 CYP17A1P05093 508 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 YWHAQP27348 245 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 ATICP31939 592 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 OPRD1P41143 372 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 LIMK1P53667 647 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 CACNA2D1P54289 1103 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 STPG1Q5TH74 334 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF516Q92618 1163 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 MED10Q9BTT4 135 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 BACH2Q9BYV9 841 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 OBSL1O75147 1896 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 ATP8B3O60423 1300 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 CASP4P49662 377 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 CUL4BQ13620 913 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF699Q32M78 642 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 ANO7Q6IWH7 933 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 NUP93Q8N1F7 819 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 USP33Q8TEY7 942 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 FBXO32Q969P5 355 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 K7EQS6 105 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 EHHADHQ08426 723 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 DHCR24Q15392 516 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 RNF43Q68DV7 783 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 TCEAL3Q969E4 200 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 OLFM2O95897 454 aa22.15■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 ADH1CP00326 375 aa22.15■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 CDH8P55286 799 aa22.15■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.15■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.15■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.15■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 PNKPQ96T60 521 aa22.15■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.15■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.15■■□□□ 1.14
PABPC1-218ENST00000521865 ALDH1A2O94788 518 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 CAVIN2O95810 425 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 APODP05090 189 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SLC6A11P48066 632 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 AP3M2P53677 418 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 NCOA4Q13772 614 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 GAB4Q2WGN9 574 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 C11orf74Q86VG3 221 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 TNIP3Q96KP6 325 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 KCNK16Q96T55 309 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ANTXRLA6NF34 631 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 F13A1P00488 732 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ADH5P11766 374 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 KDSRQ06136 332 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 CRY1Q16526 586 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 HECTD3Q5T447 861 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 RESP18Q5W5W9 173 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 FAM35AQ86V20 835 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 HSCBQ8IWL3 235 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 EDEM2Q9BV94 578 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-218ENST00000521865 NACA2Q9H009 215 aa22.13■■□□□ 1.13
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