RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492354.1

SZRD1-210, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-210ENST00000492354 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 CREBZFQ9NS37 354 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 HMGXB4Q9UGU5 601 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 OGTO15294 1046 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 MSCO60682 206 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 FAM155BO75949 473 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ITGAVP06756 1048 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 KDELR1P24390 212 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 MIPP30301 263 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ELK3P41970 407 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 CLCN3P51790 818 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 EBF2Q9HAK2 575 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 M0QYV0 167 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 MCF2LO15068 1137 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 DCTN3O75935 186 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 PAX7P23759 505 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 RGS7P49802 495 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ZNF132P52740 706 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 RAD23BP54727 409 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 TAF11Q15544 211 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ZNF667Q5HYK9 610 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 RELL1Q8IUW5 271 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 TTC8Q8TAM2 541 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 SLC35B2Q8TB61 432 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 PTPRN2Q92932 1015 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 TWNKQ96RR1 684 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 SMYD3Q9H7B4 428 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 TYROBPO43914 113 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 LPXNO60711 386 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 INHBAP08476 426 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 KRT7P08729 469 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 TM4SF4P48230 202 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 IRX4P78413 519 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 PPM1NQ8N819 430 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 MIEF2Q96C03 454 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 HHIPL1Q96JK4 782 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ZNF570Q96NI8 536 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 HEY2Q9UBP5 337 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 GINS2Q9Y248 185 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ITGB3P05106 788 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 KITP10721 976 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 PYGBP11216 843 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 CPA2P48052 419 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 VEGFBP49765 207 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 PTK7Q13308 1070 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 LRRC38Q5VT99 294 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 OR6B2Q6IFH4 312 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 FAM13CQ8NE31 585 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 FAF2Q96CS3 445 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 RNF19AQ9NV58 838 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 SENP1Q9P0U3 644 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 KBTBD13C9JR72 458 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 NEBLO76041 1014 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-210ENST00000492354 ERBB2P04626 1255 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms