RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478423.6

NPHP4-208, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 2

Gene NPHP4, Length 4,467 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-208ENST00000478423 ALDH1A1P00352 501 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 CALCAP01258 141 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 PEX19P40855 299 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 FBXO32Q969P5 355 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 RAB21Q9UL25 225 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 RECQL4O94761 1208 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 FDFT1P37268 417 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 PSEN2P49810 448 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 CAPSQ13938 189 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 TTC23LQ6PF05 361 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 RFX8Q6ZV50 586 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 SRLQ86TD4 932 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 AKAP12Q02952 1782 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 TGM2P21980 687 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 CNPY4Q8N129 248 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 APOL2Q9BQE5 337 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 NFASCO94856 1347 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 ANXA9O76027 345 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 NUMBP49757 651 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 CALML6Q8TD86 181 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 JCHAINP01591 159 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 SHC3Q92529 594 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 H3BQF6 201 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 EDEM1Q92611 657 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 DRC3Q9H069 523 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 SCOCQ9UIL1 159 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 FBXO21O94952 628 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 ENO1P06733 434 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 PAEPP09466 180 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 ADIGQ0VDE8 80 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 FAM84AQ96KN4 292 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 DNAJC18Q9H819 358 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 HES2Q9Y543 173 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 F8VP50 259 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 MICAL2O94851 1124 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 KCNA2P16389 499 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 HADHAP40939 763 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 ZACNQ401N2 412 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 GAD1Q99259 594 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 PGM1P36871 562 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 BFSP2Q13515 415 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 NPY5RQ15761 445 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 LCA5Q86VQ0 697 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 GIPC2Q8TF65 315 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 SNX19Q92543 992 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 CAVIN3Q969G5 261 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 NCLNQ969V3 563 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 E2F7Q96AV8 911 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 CUL3Q13618 768 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-208ENST00000478423 TREML2Q5T2D2 321 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms