RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466964.1

LAMC1-202, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 4

Gene LAMC1, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-202ENST00000466964 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.06□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.06□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM131Q92545 1883 aa11.06□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 MYMKA6NI61 221 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 SFI1A8K8P3 1242 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 J3QKU1 62 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 ZNF217O75362 1048 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 APODP05090 189 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 HDCP19113 662 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 NDUFV2P19404 249 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 TAF6P49848 677 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 STRN3Q13033 797 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 PLEKHG6Q3KR16 790 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 LIMS2Q7Z4I7 341 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 TTC30AQ86WT1 665 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 THEM5Q8N1Q8 247 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 GALNT15Q8N3T1 639 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 CEP295NLQ96MC4 621 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 COL12A1Q99715 3063 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 GABRG3Q99928 467 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 RNF38Q9H0F5 515 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 ASB7Q9H672 318 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 IL21RQ9HBE5 538 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 TEX15Q9BXT5 2789 aa11.05□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 CKAP5Q14008 2032 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 KPNA7A9QM74 516 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 GABRDO14764 452 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 MAGEA11P43364 429 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 RESTQ13127 1097 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 KCNB1Q14721 858 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM132DQ14C87 1099 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 HYIQ5T013 277 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 FAM171BQ6P995 826 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 METTL23Q86XA0 190 aa11.04□□□□□ -0.64
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LAMC1-202ENST00000466964 SPATA17Q96L03 361 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 FIZ1Q96SL8 496 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 PDRG1Q9NUG6 133 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 L1RE1Q9UN81 338 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.04□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 MYLKQ15746 1914 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 A0A1B0GTW7 788 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 FLRT2O43155 660 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 CILPO75339 1184 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 C7P10643 843 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 PDE6CP51160 858 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 USP46P62068 366 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 FSIP1Q8NA03 581 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 TERB1Q8NA31 727 aa11.03□□□□□ -0.64
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LAMC1-202ENST00000466964 TM7SF3Q9NS93 570 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 LRWD1Q9UFC0 647 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 DNM3Q9UQ16 869 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 BTBD3Q9Y2F9 522 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 FLNCQ14315 2725 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 NUMA1Q14980 2115 aa11.03□□□□□ -0.64
LAMC1-202ENST00000466964 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.02□□□□□ -0.65
LAMC1-202ENST00000466964 ZNF840PA6NDX5 716 aa11.02□□□□□ -0.65
LAMC1-202ENST00000466964 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
LAMC1-202ENST00000466964 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
LAMC1-202ENST00000466964 TULP3O75386 442 aa11.02□□□□□ -0.65
LAMC1-202ENST00000466964 REC8O95072 547 aa11.02□□□□□ -0.65
LAMC1-202ENST00000466964 ADH1CP00326 375 aa11.02□□□□□ -0.65
LAMC1-202ENST00000466964 IGLV3-19P01714 112 aa11.02□□□□□ -0.65
LAMC1-202ENST00000466964 ADH5P11766 374 aa11.02□□□□□ -0.65
LAMC1-202ENST00000466964 HOXB2P14652 356 aa11.02□□□□□ -0.65
LAMC1-202ENST00000466964 SCP2P22307 547 aa11.02□□□□□ -0.65
LAMC1-202ENST00000466964 NTSR1P30989 418 aa11.02□□□□□ -0.65
LAMC1-202ENST00000466964 PSEN1P49768 467 aa11.02□□□□□ -0.65
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